Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUN8

Lbx2, Transcription factor LBX2, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx2Q9WUN8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lbx2Q9WUN8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lbx2Q9WUN8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lbx2Q9WUN8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lbx2Q9WUN8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lbx2Q9WUN8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lbx2Q9WUN8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lbx2Q9WUN8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Lbx2Q9WUN8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lbx2Q9WUN8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lbx2Q9WUN8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lbx2Q9WUN8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lbx2Q9WUN8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lbx2Q9WUN8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lbx2Q9WUN8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lbx2Q9WUN8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lbx2Q9WUN8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lbx2Q9WUN8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lbx2Q9WUN8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lbx2Q9WUN8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lbx2Q9WUN8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lbx2Q9WUN8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lbx2Q9WUN8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lbx2Q9WUN8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lbx2Q9WUN8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lbx2Q9WUN8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lbx2Q9WUN8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lbx2Q9WUN8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lbx2Q9WUN8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lbx2Q9WUN8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lbx2Q9WUN8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lbx2Q9WUN8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lbx2Q9WUN8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lbx2Q9WUN8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lbx2Q9WUN8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lbx2Q9WUN8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lbx2Q9WUN8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lbx2Q9WUN8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lbx2Q9WUN8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lbx2Q9WUN8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lbx2Q9WUN8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lbx2Q9WUN8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Lbx2Q9WUN8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lbx2Q9WUN8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lbx2Q9WUN8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lbx2Q9WUN8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lbx2Q9WUN8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lbx2Q9WUN8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lbx2Q9WUN8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lbx2Q9WUN8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lbx2Q9WUN8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lbx2Q9WUN8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lbx2Q9WUN8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lbx2Q9WUN8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lbx2Q9WUN8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lbx2Q9WUN8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lbx2Q9WUN8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lbx2Q9WUN8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lbx2Q9WUN8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lbx2Q9WUN8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lbx2Q9WUN8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lbx2Q9WUN8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lbx2Q9WUN8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lbx2Q9WUN8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lbx2Q9WUN8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lbx2Q9WUN8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lbx2Q9WUN8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lbx2Q9WUN8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lbx2Q9WUN8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lbx2Q9WUN8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lbx2Q9WUN8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lbx2Q9WUN8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lbx2Q9WUN8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lbx2Q9WUN8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lbx2Q9WUN8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lbx2Q9WUN8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lbx2Q9WUN8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lbx2Q9WUN8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lbx2Q9WUN8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lbx2Q9WUN8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lbx2Q9WUN8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lbx2Q9WUN8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lbx2Q9WUN8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lbx2Q9WUN8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lbx2Q9WUN8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lbx2Q9WUN8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lbx2Q9WUN8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lbx2Q9WUN8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lbx2Q9WUN8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lbx2Q9WUN8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lbx2Q9WUN8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lbx2Q9WUN8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lbx2Q9WUN8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lbx2Q9WUN8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lbx2Q9WUN8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lbx2Q9WUN8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lbx2Q9WUN8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lbx2Q9WUN8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lbx2Q9WUN8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lbx2Q9WUN8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms