Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S8

Capn7, Calpain-7, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn7Q9R1S8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn7Q9R1S8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn7Q9R1S8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn7Q9R1S8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn7Q9R1S8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capn7Q9R1S8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capn7Q9R1S8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Capn7Q9R1S8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Capn7Q9R1S8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Capn7Q9R1S8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn7Q9R1S8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Capn7Q9R1S8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Capn7Q9R1S8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Capn7Q9R1S8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Capn7Q9R1S8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Capn7Q9R1S8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Capn7Q9R1S8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Capn7Q9R1S8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Capn7Q9R1S8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Capn7Q9R1S8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Capn7Q9R1S8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Capn7Q9R1S8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Capn7Q9R1S8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Capn7Q9R1S8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn7Q9R1S8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn7Q9R1S8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn7Q9R1S8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Capn7Q9R1S8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Capn7Q9R1S8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Capn7Q9R1S8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn7Q9R1S8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn7Q9R1S8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn7Q9R1S8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn7Q9R1S8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn7Q9R1S8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capn7Q9R1S8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn7Q9R1S8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn7Q9R1S8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn7Q9R1S8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn7Q9R1S8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn7Q9R1S8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn7Q9R1S8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn7Q9R1S8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn7Q9R1S8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn7Q9R1S8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn7Q9R1S8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn7Q9R1S8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn7Q9R1S8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn7Q9R1S8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn7Q9R1S8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn7Q9R1S8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn7Q9R1S8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn7Q9R1S8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn7Q9R1S8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn7Q9R1S8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn7Q9R1S8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn7Q9R1S8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn7Q9R1S8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn7Q9R1S8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn7Q9R1S8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn7Q9R1S8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn7Q9R1S8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn7Q9R1S8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn7Q9R1S8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn7Q9R1S8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn7Q9R1S8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn7Q9R1S8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn7Q9R1S8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn7Q9R1S8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Capn7Q9R1S8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Capn7Q9R1S8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Capn7Q9R1S8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn7Q9R1S8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn7Q9R1S8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn7Q9R1S8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn7Q9R1S8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn7Q9R1S8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn7Q9R1S8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn7Q9R1S8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn7Q9R1S8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn7Q9R1S8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn7Q9R1S8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn7Q9R1S8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn7Q9R1S8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn7Q9R1S8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn7Q9R1S8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn7Q9R1S8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn7Q9R1S8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn7Q9R1S8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn7Q9R1S8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn7Q9R1S8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn7Q9R1S8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn7Q9R1S8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn7Q9R1S8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Capn7Q9R1S8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn7Q9R1S8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn7Q9R1S8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn7Q9R1S8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn7Q9R1S8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn7Q9R1S8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms