Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Plod1Q9R0E2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Plod1Q9R0E2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Plod1Q9R0E2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Plod1Q9R0E2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Plod1Q9R0E2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Plod1Q9R0E2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Plod1Q9R0E2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Plod1Q9R0E2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Plod1Q9R0E2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Plod1Q9R0E2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Plod1Q9R0E2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Plod1Q9R0E2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Plod1Q9R0E2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Plod1Q9R0E2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Plod1Q9R0E2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Plod1Q9R0E2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Plod1Q9R0E2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Plod1Q9R0E2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Plod1Q9R0E2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Plod1Q9R0E2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Plod1Q9R0E2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Plod1Q9R0E2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Plod1Q9R0E2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Plod1Q9R0E2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Plod1Q9R0E2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Plod1Q9R0E2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Plod1Q9R0E2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Plod1Q9R0E2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Plod1Q9R0E2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Plod1Q9R0E2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Plod1Q9R0E2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Plod1Q9R0E2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Plod1Q9R0E2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Plod1Q9R0E2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Plod1Q9R0E2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Plod1Q9R0E2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Plod1Q9R0E2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Plod1Q9R0E2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Plod1Q9R0E2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Plod1Q9R0E2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Plod1Q9R0E2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Plod1Q9R0E2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Plod1Q9R0E2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Plod1Q9R0E2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Plod1Q9R0E2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Plod1Q9R0E2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Plod1Q9R0E2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Plod1Q9R0E2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Plod1Q9R0E2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Plod1Q9R0E2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Plod1Q9R0E2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Plod1Q9R0E2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Plod1Q9R0E2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Plod1Q9R0E2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Plod1Q9R0E2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Plod1Q9R0E2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Plod1Q9R0E2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Plod1Q9R0E2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Plod1Q9R0E2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Plod1Q9R0E2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Plod1Q9R0E2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Plod1Q9R0E2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Plod1Q9R0E2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Plod1Q9R0E2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Plod1Q9R0E2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Plod1Q9R0E2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Plod1Q9R0E2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Plod1Q9R0E2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Plod1Q9R0E2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Plod1Q9R0E2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Plod1Q9R0E2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plod1Q9R0E2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plod1Q9R0E2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plod1Q9R0E2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plod1Q9R0E2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plod1Q9R0E2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plod1Q9R0E2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plod1Q9R0E2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plod1Q9R0E2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plod1Q9R0E2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plod1Q9R0E2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plod1Q9R0E2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plod1Q9R0E2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Plod1Q9R0E2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plod1Q9R0E2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plod1Q9R0E2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plod1Q9R0E2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plod1Q9R0E2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Plod1Q9R0E2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plod1Q9R0E2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plod1Q9R0E2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Plod1Q9R0E2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Plod1Q9R0E2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plod1Q9R0E2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Plod1Q9R0E2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plod1Q9R0E2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Plod1Q9R0E2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plod1Q9R0E2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plod1Q9R0E2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms