Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Lamc3Q9R0B6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Lamc3Q9R0B6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
Lamc3Q9R0B6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
Lamc3Q9R0B6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Lamc3Q9R0B6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
Lamc3Q9R0B6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Lamc3Q9R0B6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Lamc3Q9R0B6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Lamc3Q9R0B6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Lamc3Q9R0B6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Lamc3Q9R0B6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Lamc3Q9R0B6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Lamc3Q9R0B6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC41.16■■■■■ 4.18
Lamc3Q9R0B6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Lamc3Q9R0B6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.18
Lamc3Q9R0B6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
Lamc3Q9R0B6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
Lamc3Q9R0B6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Lamc3Q9R0B6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Lamc3Q9R0B6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Lamc3Q9R0B6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Lamc3Q9R0B6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC41.09■■■■■ 4.17
Lamc3Q9R0B6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
Lamc3Q9R0B6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
Lamc3Q9R0B6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC41.06■■■■■ 4.16
Lamc3Q9R0B6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Lamc3Q9R0B6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Lamc3Q9R0B6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Lamc3Q9R0B6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Lamc3Q9R0B6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
Lamc3Q9R0B6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
Lamc3Q9R0B6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
Lamc3Q9R0B6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
Lamc3Q9R0B6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
Lamc3Q9R0B6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Lamc3Q9R0B6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Lamc3Q9R0B6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Lamc3Q9R0B6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Lamc3Q9R0B6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Lamc3Q9R0B6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Lamc3Q9R0B6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
Lamc3Q9R0B6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
Lamc3Q9R0B6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Lamc3Q9R0B6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Lamc3Q9R0B6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
Lamc3Q9R0B6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Lamc3Q9R0B6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
Lamc3Q9R0B6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC40.92■■■■■ 4.14
Lamc3Q9R0B6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
Lamc3Q9R0B6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Lamc3Q9R0B6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
Lamc3Q9R0B6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
Lamc3Q9R0B6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Lamc3Q9R0B6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
Lamc3Q9R0B6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
Lamc3Q9R0B6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Lamc3Q9R0B6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Lamc3Q9R0B6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
Lamc3Q9R0B6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Lamc3Q9R0B6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Lamc3Q9R0B6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Lamc3Q9R0B6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
Lamc3Q9R0B6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.13
Lamc3Q9R0B6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
Lamc3Q9R0B6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
Lamc3Q9R0B6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
Lamc3Q9R0B6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Lamc3Q9R0B6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Lamc3Q9R0B6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Lamc3Q9R0B6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Lamc3Q9R0B6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
Lamc3Q9R0B6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
Lamc3Q9R0B6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
Lamc3Q9R0B6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Lamc3Q9R0B6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Lamc3Q9R0B6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Lamc3Q9R0B6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Lamc3Q9R0B6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC40.76■■■■■ 4.12
Lamc3Q9R0B6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Lamc3Q9R0B6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
Lamc3Q9R0B6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
Lamc3Q9R0B6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Lamc3Q9R0B6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Lamc3Q9R0B6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
Lamc3Q9R0B6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Lamc3Q9R0B6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Lamc3Q9R0B6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Lamc3Q9R0B6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Lamc3Q9R0B6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Lamc3Q9R0B6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
Lamc3Q9R0B6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.09
Lamc3Q9R0B6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
Lamc3Q9R0B6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Lamc3Q9R0B6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
Lamc3Q9R0B6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Lamc3Q9R0B6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Lamc3Q9R0B6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Lamc3Q9R0B6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
Lamc3Q9R0B6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms