Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ8

H2afy, Core histone macro-H2A.1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afyQ9QZQ8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2afyQ9QZQ8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2afyQ9QZQ8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2afyQ9QZQ8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2afyQ9QZQ8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2afyQ9QZQ8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2afyQ9QZQ8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2afyQ9QZQ8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2afyQ9QZQ8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2afyQ9QZQ8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2afyQ9QZQ8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2afyQ9QZQ8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2afyQ9QZQ8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2afyQ9QZQ8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2afyQ9QZQ8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2afyQ9QZQ8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2afyQ9QZQ8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2afyQ9QZQ8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2afyQ9QZQ8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
H2afyQ9QZQ8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2afyQ9QZQ8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2afyQ9QZQ8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2afyQ9QZQ8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2afyQ9QZQ8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2afyQ9QZQ8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2afyQ9QZQ8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2afyQ9QZQ8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2afyQ9QZQ8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2afyQ9QZQ8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
H2afyQ9QZQ8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
H2afyQ9QZQ8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2afyQ9QZQ8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2afyQ9QZQ8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2afyQ9QZQ8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2afyQ9QZQ8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2afyQ9QZQ8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2afyQ9QZQ8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2afyQ9QZQ8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2afyQ9QZQ8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2afyQ9QZQ8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2afyQ9QZQ8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2afyQ9QZQ8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2afyQ9QZQ8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2afyQ9QZQ8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2afyQ9QZQ8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2afyQ9QZQ8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
H2afyQ9QZQ8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2afyQ9QZQ8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2afyQ9QZQ8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2afyQ9QZQ8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2afyQ9QZQ8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2afyQ9QZQ8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
H2afyQ9QZQ8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2afyQ9QZQ8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2afyQ9QZQ8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2afyQ9QZQ8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2afyQ9QZQ8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2afyQ9QZQ8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
H2afyQ9QZQ8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2afyQ9QZQ8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2afyQ9QZQ8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2afyQ9QZQ8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2afyQ9QZQ8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2afyQ9QZQ8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2afyQ9QZQ8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2afyQ9QZQ8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2afyQ9QZQ8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2afyQ9QZQ8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2afyQ9QZQ8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2afyQ9QZQ8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2afyQ9QZQ8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2afyQ9QZQ8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2afyQ9QZQ8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
H2afyQ9QZQ8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2afyQ9QZQ8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2afyQ9QZQ8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2afyQ9QZQ8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2afyQ9QZQ8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2afyQ9QZQ8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2afyQ9QZQ8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2afyQ9QZQ8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2afyQ9QZQ8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2afyQ9QZQ8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2afyQ9QZQ8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2afyQ9QZQ8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2afyQ9QZQ8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2afyQ9QZQ8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2afyQ9QZQ8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2afyQ9QZQ8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2afyQ9QZQ8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2afyQ9QZQ8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2afyQ9QZQ8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2afyQ9QZQ8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2afyQ9QZQ8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2afyQ9QZQ8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2afyQ9QZQ8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2afyQ9QZQ8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2afyQ9QZQ8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
H2afyQ9QZQ8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
H2afyQ9QZQ8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms