Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PnckQ9QYK9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PnckQ9QYK9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PnckQ9QYK9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PnckQ9QYK9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PnckQ9QYK9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PnckQ9QYK9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PnckQ9QYK9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PnckQ9QYK9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PnckQ9QYK9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PnckQ9QYK9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PnckQ9QYK9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PnckQ9QYK9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PnckQ9QYK9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PnckQ9QYK9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PnckQ9QYK9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PnckQ9QYK9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PnckQ9QYK9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PnckQ9QYK9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PnckQ9QYK9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PnckQ9QYK9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PnckQ9QYK9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PnckQ9QYK9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PnckQ9QYK9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PnckQ9QYK9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PnckQ9QYK9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PnckQ9QYK9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PnckQ9QYK9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PnckQ9QYK9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PnckQ9QYK9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PnckQ9QYK9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PnckQ9QYK9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PnckQ9QYK9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PnckQ9QYK9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PnckQ9QYK9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PnckQ9QYK9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PnckQ9QYK9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PnckQ9QYK9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PnckQ9QYK9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PnckQ9QYK9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PnckQ9QYK9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PnckQ9QYK9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PnckQ9QYK9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PnckQ9QYK9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PnckQ9QYK9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PnckQ9QYK9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PnckQ9QYK9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PnckQ9QYK9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PnckQ9QYK9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PnckQ9QYK9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PnckQ9QYK9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PnckQ9QYK9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PnckQ9QYK9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PnckQ9QYK9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PnckQ9QYK9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PnckQ9QYK9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PnckQ9QYK9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PnckQ9QYK9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PnckQ9QYK9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PnckQ9QYK9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PnckQ9QYK9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PnckQ9QYK9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PnckQ9QYK9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PnckQ9QYK9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PnckQ9QYK9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PnckQ9QYK9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PnckQ9QYK9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PnckQ9QYK9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PnckQ9QYK9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PnckQ9QYK9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PnckQ9QYK9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PnckQ9QYK9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PnckQ9QYK9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PnckQ9QYK9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PnckQ9QYK9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PnckQ9QYK9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PnckQ9QYK9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PnckQ9QYK9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PnckQ9QYK9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PnckQ9QYK9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PnckQ9QYK9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PnckQ9QYK9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PnckQ9QYK9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PnckQ9QYK9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PnckQ9QYK9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PnckQ9QYK9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PnckQ9QYK9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PnckQ9QYK9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PnckQ9QYK9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PnckQ9QYK9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PnckQ9QYK9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PnckQ9QYK9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PnckQ9QYK9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PnckQ9QYK9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PnckQ9QYK9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PnckQ9QYK9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PnckQ9QYK9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PnckQ9QYK9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PnckQ9QYK9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PnckQ9QYK9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms