Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXQ1

Pde7b, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde7bQ9QXQ1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde7bQ9QXQ1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde7bQ9QXQ1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde7bQ9QXQ1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde7bQ9QXQ1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde7bQ9QXQ1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde7bQ9QXQ1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde7bQ9QXQ1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde7bQ9QXQ1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde7bQ9QXQ1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde7bQ9QXQ1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde7bQ9QXQ1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde7bQ9QXQ1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde7bQ9QXQ1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde7bQ9QXQ1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde7bQ9QXQ1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde7bQ9QXQ1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde7bQ9QXQ1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde7bQ9QXQ1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pde7bQ9QXQ1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pde7bQ9QXQ1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde7bQ9QXQ1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde7bQ9QXQ1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde7bQ9QXQ1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pde7bQ9QXQ1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde7bQ9QXQ1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde7bQ9QXQ1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde7bQ9QXQ1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde7bQ9QXQ1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pde7bQ9QXQ1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pde7bQ9QXQ1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde7bQ9QXQ1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde7bQ9QXQ1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pde7bQ9QXQ1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde7bQ9QXQ1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pde7bQ9QXQ1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pde7bQ9QXQ1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Pde7bQ9QXQ1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde7bQ9QXQ1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pde7bQ9QXQ1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pde7bQ9QXQ1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pde7bQ9QXQ1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pde7bQ9QXQ1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pde7bQ9QXQ1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pde7bQ9QXQ1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde7bQ9QXQ1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde7bQ9QXQ1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde7bQ9QXQ1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Pde7bQ9QXQ1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde7bQ9QXQ1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pde7bQ9QXQ1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde7bQ9QXQ1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde7bQ9QXQ1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pde7bQ9QXQ1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pde7bQ9QXQ1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pde7bQ9QXQ1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde7bQ9QXQ1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pde7bQ9QXQ1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde7bQ9QXQ1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde7bQ9QXQ1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde7bQ9QXQ1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde7bQ9QXQ1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde7bQ9QXQ1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde7bQ9QXQ1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde7bQ9QXQ1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde7bQ9QXQ1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde7bQ9QXQ1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde7bQ9QXQ1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde7bQ9QXQ1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde7bQ9QXQ1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde7bQ9QXQ1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde7bQ9QXQ1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde7bQ9QXQ1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde7bQ9QXQ1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pde7bQ9QXQ1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pde7bQ9QXQ1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pde7bQ9QXQ1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pde7bQ9QXQ1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde7bQ9QXQ1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde7bQ9QXQ1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde7bQ9QXQ1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pde7bQ9QXQ1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pde7bQ9QXQ1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde7bQ9QXQ1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde7bQ9QXQ1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde7bQ9QXQ1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde7bQ9QXQ1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde7bQ9QXQ1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde7bQ9QXQ1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde7bQ9QXQ1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde7bQ9QXQ1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pde7bQ9QXQ1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pde7bQ9QXQ1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pde7bQ9QXQ1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pde7bQ9QXQ1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pde7bQ9QXQ1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde7bQ9QXQ1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde7bQ9QXQ1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde7bQ9QXQ1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde7bQ9QXQ1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms