Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUJ7

Acsl4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl4Q9QUJ7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Acsl4Q9QUJ7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Acsl4Q9QUJ7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Acsl4Q9QUJ7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Acsl4Q9QUJ7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Acsl4Q9QUJ7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Acsl4Q9QUJ7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Acsl4Q9QUJ7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Acsl4Q9QUJ7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Acsl4Q9QUJ7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Acsl4Q9QUJ7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Acsl4Q9QUJ7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Acsl4Q9QUJ7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Acsl4Q9QUJ7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Acsl4Q9QUJ7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Acsl4Q9QUJ7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Acsl4Q9QUJ7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Acsl4Q9QUJ7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Acsl4Q9QUJ7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Acsl4Q9QUJ7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Acsl4Q9QUJ7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Acsl4Q9QUJ7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Acsl4Q9QUJ7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Acsl4Q9QUJ7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Acsl4Q9QUJ7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Acsl4Q9QUJ7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Acsl4Q9QUJ7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Acsl4Q9QUJ7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Acsl4Q9QUJ7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Acsl4Q9QUJ7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Acsl4Q9QUJ7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Acsl4Q9QUJ7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Acsl4Q9QUJ7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Acsl4Q9QUJ7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Acsl4Q9QUJ7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Acsl4Q9QUJ7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Acsl4Q9QUJ7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Acsl4Q9QUJ7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Acsl4Q9QUJ7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Acsl4Q9QUJ7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Acsl4Q9QUJ7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Acsl4Q9QUJ7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Acsl4Q9QUJ7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Acsl4Q9QUJ7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Acsl4Q9QUJ7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Acsl4Q9QUJ7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Acsl4Q9QUJ7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Acsl4Q9QUJ7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Acsl4Q9QUJ7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Acsl4Q9QUJ7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Acsl4Q9QUJ7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Acsl4Q9QUJ7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Acsl4Q9QUJ7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Acsl4Q9QUJ7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Acsl4Q9QUJ7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Acsl4Q9QUJ7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Acsl4Q9QUJ7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Acsl4Q9QUJ7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Acsl4Q9QUJ7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Acsl4Q9QUJ7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Acsl4Q9QUJ7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Acsl4Q9QUJ7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Acsl4Q9QUJ7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Acsl4Q9QUJ7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Acsl4Q9QUJ7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Acsl4Q9QUJ7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Acsl4Q9QUJ7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Acsl4Q9QUJ7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Acsl4Q9QUJ7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Acsl4Q9QUJ7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Acsl4Q9QUJ7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Acsl4Q9QUJ7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Acsl4Q9QUJ7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Acsl4Q9QUJ7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Acsl4Q9QUJ7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Acsl4Q9QUJ7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Acsl4Q9QUJ7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Acsl4Q9QUJ7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Acsl4Q9QUJ7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Acsl4Q9QUJ7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Acsl4Q9QUJ7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Acsl4Q9QUJ7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Acsl4Q9QUJ7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Acsl4Q9QUJ7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Acsl4Q9QUJ7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Acsl4Q9QUJ7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Acsl4Q9QUJ7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Acsl4Q9QUJ7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Acsl4Q9QUJ7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Acsl4Q9QUJ7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Acsl4Q9QUJ7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Acsl4Q9QUJ7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Acsl4Q9QUJ7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Acsl4Q9QUJ7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Acsl4Q9QUJ7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Acsl4Q9QUJ7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Acsl4Q9QUJ7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Acsl4Q9QUJ7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Acsl4Q9QUJ7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Acsl4Q9QUJ7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms