Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdgfl3Q9JMG7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdgfl3Q9JMG7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdgfl3Q9JMG7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdgfl3Q9JMG7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdgfl3Q9JMG7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdgfl3Q9JMG7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdgfl3Q9JMG7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdgfl3Q9JMG7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdgfl3Q9JMG7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdgfl3Q9JMG7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdgfl3Q9JMG7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdgfl3Q9JMG7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hdgfl3Q9JMG7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hdgfl3Q9JMG7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hdgfl3Q9JMG7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hdgfl3Q9JMG7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hdgfl3Q9JMG7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hdgfl3Q9JMG7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hdgfl3Q9JMG7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hdgfl3Q9JMG7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hdgfl3Q9JMG7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hdgfl3Q9JMG7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hdgfl3Q9JMG7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hdgfl3Q9JMG7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hdgfl3Q9JMG7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Hdgfl3Q9JMG7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hdgfl3Q9JMG7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hdgfl3Q9JMG7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hdgfl3Q9JMG7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hdgfl3Q9JMG7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hdgfl3Q9JMG7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hdgfl3Q9JMG7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hdgfl3Q9JMG7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hdgfl3Q9JMG7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hdgfl3Q9JMG7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hdgfl3Q9JMG7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hdgfl3Q9JMG7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hdgfl3Q9JMG7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hdgfl3Q9JMG7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hdgfl3Q9JMG7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hdgfl3Q9JMG7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hdgfl3Q9JMG7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hdgfl3Q9JMG7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hdgfl3Q9JMG7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hdgfl3Q9JMG7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hdgfl3Q9JMG7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hdgfl3Q9JMG7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hdgfl3Q9JMG7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hdgfl3Q9JMG7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hdgfl3Q9JMG7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hdgfl3Q9JMG7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hdgfl3Q9JMG7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdgfl3Q9JMG7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdgfl3Q9JMG7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdgfl3Q9JMG7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdgfl3Q9JMG7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdgfl3Q9JMG7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdgfl3Q9JMG7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdgfl3Q9JMG7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdgfl3Q9JMG7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdgfl3Q9JMG7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdgfl3Q9JMG7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdgfl3Q9JMG7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdgfl3Q9JMG7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdgfl3Q9JMG7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdgfl3Q9JMG7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdgfl3Q9JMG7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdgfl3Q9JMG7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdgfl3Q9JMG7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdgfl3Q9JMG7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdgfl3Q9JMG7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdgfl3Q9JMG7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdgfl3Q9JMG7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdgfl3Q9JMG7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdgfl3Q9JMG7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdgfl3Q9JMG7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdgfl3Q9JMG7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdgfl3Q9JMG7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hdgfl3Q9JMG7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdgfl3Q9JMG7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdgfl3Q9JMG7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdgfl3Q9JMG7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdgfl3Q9JMG7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdgfl3Q9JMG7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdgfl3Q9JMG7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdgfl3Q9JMG7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdgfl3Q9JMG7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdgfl3Q9JMG7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hdgfl3Q9JMG7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hdgfl3Q9JMG7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hdgfl3Q9JMG7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hdgfl3Q9JMG7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hdgfl3Q9JMG7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hdgfl3Q9JMG7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hdgfl3Q9JMG7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hdgfl3Q9JMG7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hdgfl3Q9JMG7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hdgfl3Q9JMG7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms