Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sfmbt1Q9JMD1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sfmbt1Q9JMD1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sfmbt1Q9JMD1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sfmbt1Q9JMD1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Sfmbt1Q9JMD1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sfmbt1Q9JMD1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Sfmbt1Q9JMD1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Sfmbt1Q9JMD1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Sfmbt1Q9JMD1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sfmbt1Q9JMD1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sfmbt1Q9JMD1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Sfmbt1Q9JMD1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sfmbt1Q9JMD1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sfmbt1Q9JMD1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sfmbt1Q9JMD1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sfmbt1Q9JMD1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sfmbt1Q9JMD1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sfmbt1Q9JMD1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sfmbt1Q9JMD1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sfmbt1Q9JMD1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sfmbt1Q9JMD1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sfmbt1Q9JMD1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sfmbt1Q9JMD1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sfmbt1Q9JMD1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sfmbt1Q9JMD1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sfmbt1Q9JMD1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sfmbt1Q9JMD1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sfmbt1Q9JMD1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sfmbt1Q9JMD1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sfmbt1Q9JMD1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sfmbt1Q9JMD1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sfmbt1Q9JMD1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Sfmbt1Q9JMD1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sfmbt1Q9JMD1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Sfmbt1Q9JMD1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sfmbt1Q9JMD1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sfmbt1Q9JMD1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sfmbt1Q9JMD1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sfmbt1Q9JMD1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sfmbt1Q9JMD1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sfmbt1Q9JMD1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sfmbt1Q9JMD1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sfmbt1Q9JMD1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sfmbt1Q9JMD1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sfmbt1Q9JMD1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sfmbt1Q9JMD1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sfmbt1Q9JMD1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sfmbt1Q9JMD1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sfmbt1Q9JMD1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sfmbt1Q9JMD1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sfmbt1Q9JMD1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sfmbt1Q9JMD1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sfmbt1Q9JMD1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sfmbt1Q9JMD1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sfmbt1Q9JMD1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sfmbt1Q9JMD1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sfmbt1Q9JMD1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sfmbt1Q9JMD1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sfmbt1Q9JMD1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sfmbt1Q9JMD1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sfmbt1Q9JMD1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sfmbt1Q9JMD1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sfmbt1Q9JMD1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Sfmbt1Q9JMD1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sfmbt1Q9JMD1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sfmbt1Q9JMD1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sfmbt1Q9JMD1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sfmbt1Q9JMD1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sfmbt1Q9JMD1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sfmbt1Q9JMD1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sfmbt1Q9JMD1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sfmbt1Q9JMD1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sfmbt1Q9JMD1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sfmbt1Q9JMD1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sfmbt1Q9JMD1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sfmbt1Q9JMD1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sfmbt1Q9JMD1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sfmbt1Q9JMD1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sfmbt1Q9JMD1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sfmbt1Q9JMD1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sfmbt1Q9JMD1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sfmbt1Q9JMD1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sfmbt1Q9JMD1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sfmbt1Q9JMD1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sfmbt1Q9JMD1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sfmbt1Q9JMD1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 216.3 ms