Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Aldh9a1Q9JLJ2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Aldh9a1Q9JLJ2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aldh9a1Q9JLJ2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Aldh9a1Q9JLJ2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aldh9a1Q9JLJ2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aldh9a1Q9JLJ2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aldh9a1Q9JLJ2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aldh9a1Q9JLJ2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aldh9a1Q9JLJ2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aldh9a1Q9JLJ2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aldh9a1Q9JLJ2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aldh9a1Q9JLJ2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aldh9a1Q9JLJ2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aldh9a1Q9JLJ2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aldh9a1Q9JLJ2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aldh9a1Q9JLJ2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aldh9a1Q9JLJ2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aldh9a1Q9JLJ2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aldh9a1Q9JLJ2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aldh9a1Q9JLJ2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aldh9a1Q9JLJ2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aldh9a1Q9JLJ2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aldh9a1Q9JLJ2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aldh9a1Q9JLJ2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms