Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgm1Q9JLF6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgm1Q9JLF6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgm1Q9JLF6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgm1Q9JLF6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tgm1Q9JLF6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tgm1Q9JLF6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tgm1Q9JLF6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tgm1Q9JLF6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tgm1Q9JLF6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tgm1Q9JLF6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tgm1Q9JLF6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tgm1Q9JLF6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tgm1Q9JLF6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tgm1Q9JLF6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tgm1Q9JLF6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tgm1Q9JLF6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tgm1Q9JLF6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tgm1Q9JLF6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tgm1Q9JLF6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tgm1Q9JLF6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tgm1Q9JLF6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tgm1Q9JLF6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tgm1Q9JLF6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tgm1Q9JLF6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgm1Q9JLF6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgm1Q9JLF6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgm1Q9JLF6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tgm1Q9JLF6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tgm1Q9JLF6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tgm1Q9JLF6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tgm1Q9JLF6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tgm1Q9JLF6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tgm1Q9JLF6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tgm1Q9JLF6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tgm1Q9JLF6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tgm1Q9JLF6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tgm1Q9JLF6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tgm1Q9JLF6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tgm1Q9JLF6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tgm1Q9JLF6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tgm1Q9JLF6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tgm1Q9JLF6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tgm1Q9JLF6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tgm1Q9JLF6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tgm1Q9JLF6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tgm1Q9JLF6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tgm1Q9JLF6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tgm1Q9JLF6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tgm1Q9JLF6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tgm1Q9JLF6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Tgm1Q9JLF6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tgm1Q9JLF6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tgm1Q9JLF6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tgm1Q9JLF6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tgm1Q9JLF6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tgm1Q9JLF6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tgm1Q9JLF6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tgm1Q9JLF6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tgm1Q9JLF6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tgm1Q9JLF6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tgm1Q9JLF6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tgm1Q9JLF6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tgm1Q9JLF6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tgm1Q9JLF6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tgm1Q9JLF6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tgm1Q9JLF6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tgm1Q9JLF6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tgm1Q9JLF6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tgm1Q9JLF6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tgm1Q9JLF6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tgm1Q9JLF6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tgm1Q9JLF6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tgm1Q9JLF6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tgm1Q9JLF6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tgm1Q9JLF6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tgm1Q9JLF6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgm1Q9JLF6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgm1Q9JLF6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgm1Q9JLF6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgm1Q9JLF6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgm1Q9JLF6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgm1Q9JLF6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgm1Q9JLF6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tgm1Q9JLF6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tgm1Q9JLF6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tgm1Q9JLF6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tgm1Q9JLF6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tgm1Q9JLF6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tgm1Q9JLF6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tgm1Q9JLF6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tgm1Q9JLF6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tgm1Q9JLF6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tgm1Q9JLF6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tgm1Q9JLF6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tgm1Q9JLF6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgm1Q9JLF6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgm1Q9JLF6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tgm1Q9JLF6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tgm1Q9JLF6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.6 ms