Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cnga3Q9JJZ8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cnga3Q9JJZ8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cnga3Q9JJZ8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Cnga3Q9JJZ8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cnga3Q9JJZ8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Cnga3Q9JJZ8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cnga3Q9JJZ8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cnga3Q9JJZ8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cnga3Q9JJZ8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cnga3Q9JJZ8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cnga3Q9JJZ8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cnga3Q9JJZ8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cnga3Q9JJZ8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cnga3Q9JJZ8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cnga3Q9JJZ8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnga3Q9JJZ8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnga3Q9JJZ8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnga3Q9JJZ8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnga3Q9JJZ8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnga3Q9JJZ8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnga3Q9JJZ8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnga3Q9JJZ8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnga3Q9JJZ8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cnga3Q9JJZ8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cnga3Q9JJZ8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cnga3Q9JJZ8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cnga3Q9JJZ8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cnga3Q9JJZ8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cnga3Q9JJZ8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cnga3Q9JJZ8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cnga3Q9JJZ8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cnga3Q9JJZ8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cnga3Q9JJZ8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cnga3Q9JJZ8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cnga3Q9JJZ8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cnga3Q9JJZ8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cnga3Q9JJZ8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cnga3Q9JJZ8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cnga3Q9JJZ8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cnga3Q9JJZ8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cnga3Q9JJZ8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cnga3Q9JJZ8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cnga3Q9JJZ8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cnga3Q9JJZ8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cnga3Q9JJZ8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cnga3Q9JJZ8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cnga3Q9JJZ8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Cnga3Q9JJZ8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cnga3Q9JJZ8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cnga3Q9JJZ8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cnga3Q9JJZ8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cnga3Q9JJZ8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cnga3Q9JJZ8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cnga3Q9JJZ8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cnga3Q9JJZ8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cnga3Q9JJZ8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cnga3Q9JJZ8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cnga3Q9JJZ8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cnga3Q9JJZ8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cnga3Q9JJZ8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cnga3Q9JJZ8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Cnga3Q9JJZ8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cnga3Q9JJZ8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cnga3Q9JJZ8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cnga3Q9JJZ8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cnga3Q9JJZ8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cnga3Q9JJZ8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cnga3Q9JJZ8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cnga3Q9JJZ8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cnga3Q9JJZ8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cnga3Q9JJZ8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cnga3Q9JJZ8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cnga3Q9JJZ8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cnga3Q9JJZ8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cnga3Q9JJZ8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cnga3Q9JJZ8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cnga3Q9JJZ8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cnga3Q9JJZ8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cnga3Q9JJZ8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cnga3Q9JJZ8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cnga3Q9JJZ8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cnga3Q9JJZ8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cnga3Q9JJZ8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cnga3Q9JJZ8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cnga3Q9JJZ8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cnga3Q9JJZ8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cnga3Q9JJZ8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cnga3Q9JJZ8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnga3Q9JJZ8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnga3Q9JJZ8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cnga3Q9JJZ8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cnga3Q9JJZ8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cnga3Q9JJZ8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnga3Q9JJZ8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnga3Q9JJZ8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnga3Q9JJZ8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnga3Q9JJZ8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnga3Q9JJZ8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
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