Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smad9Q9JIW5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smad9Q9JIW5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Smad9Q9JIW5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smad9Q9JIW5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smad9Q9JIW5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smad9Q9JIW5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smad9Q9JIW5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smad9Q9JIW5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smad9Q9JIW5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smad9Q9JIW5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smad9Q9JIW5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smad9Q9JIW5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smad9Q9JIW5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smad9Q9JIW5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smad9Q9JIW5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smad9Q9JIW5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smad9Q9JIW5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smad9Q9JIW5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smad9Q9JIW5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smad9Q9JIW5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smad9Q9JIW5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smad9Q9JIW5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smad9Q9JIW5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smad9Q9JIW5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smad9Q9JIW5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smad9Q9JIW5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smad9Q9JIW5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smad9Q9JIW5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smad9Q9JIW5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smad9Q9JIW5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smad9Q9JIW5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smad9Q9JIW5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smad9Q9JIW5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smad9Q9JIW5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smad9Q9JIW5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smad9Q9JIW5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Smad9Q9JIW5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smad9Q9JIW5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smad9Q9JIW5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smad9Q9JIW5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smad9Q9JIW5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smad9Q9JIW5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smad9Q9JIW5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Smad9Q9JIW5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smad9Q9JIW5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smad9Q9JIW5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smad9Q9JIW5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smad9Q9JIW5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smad9Q9JIW5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smad9Q9JIW5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smad9Q9JIW5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smad9Q9JIW5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smad9Q9JIW5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smad9Q9JIW5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smad9Q9JIW5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smad9Q9JIW5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smad9Q9JIW5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smad9Q9JIW5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Smad9Q9JIW5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smad9Q9JIW5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smad9Q9JIW5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Smad9Q9JIW5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smad9Q9JIW5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Smad9Q9JIW5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smad9Q9JIW5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smad9Q9JIW5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smad9Q9JIW5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smad9Q9JIW5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smad9Q9JIW5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smad9Q9JIW5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smad9Q9JIW5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smad9Q9JIW5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smad9Q9JIW5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smad9Q9JIW5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smad9Q9JIW5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smad9Q9JIW5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smad9Q9JIW5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smad9Q9JIW5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smad9Q9JIW5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smad9Q9JIW5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smad9Q9JIW5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smad9Q9JIW5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smad9Q9JIW5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smad9Q9JIW5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smad9Q9JIW5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smad9Q9JIW5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smad9Q9JIW5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smad9Q9JIW5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smad9Q9JIW5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smad9Q9JIW5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smad9Q9JIW5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smad9Q9JIW5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smad9Q9JIW5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smad9Q9JIW5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smad9Q9JIW5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smad9Q9JIW5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smad9Q9JIW5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smad9Q9JIW5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smad9Q9JIW5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms