Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW9

Aldh1a3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a3Q9JHW9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Aldh1a3Q9JHW9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Aldh1a3Q9JHW9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Aldh1a3Q9JHW9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Aldh1a3Q9JHW9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Aldh1a3Q9JHW9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Aldh1a3Q9JHW9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Aldh1a3Q9JHW9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Aldh1a3Q9JHW9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Aldh1a3Q9JHW9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Aldh1a3Q9JHW9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Aldh1a3Q9JHW9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Aldh1a3Q9JHW9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Aldh1a3Q9JHW9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Aldh1a3Q9JHW9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Aldh1a3Q9JHW9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Aldh1a3Q9JHW9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Aldh1a3Q9JHW9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aldh1a3Q9JHW9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aldh1a3Q9JHW9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aldh1a3Q9JHW9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aldh1a3Q9JHW9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aldh1a3Q9JHW9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Aldh1a3Q9JHW9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Aldh1a3Q9JHW9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Aldh1a3Q9JHW9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Aldh1a3Q9JHW9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Aldh1a3Q9JHW9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aldh1a3Q9JHW9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aldh1a3Q9JHW9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aldh1a3Q9JHW9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aldh1a3Q9JHW9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aldh1a3Q9JHW9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Aldh1a3Q9JHW9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Aldh1a3Q9JHW9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Aldh1a3Q9JHW9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Aldh1a3Q9JHW9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Aldh1a3Q9JHW9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Aldh1a3Q9JHW9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Aldh1a3Q9JHW9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Aldh1a3Q9JHW9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Aldh1a3Q9JHW9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Aldh1a3Q9JHW9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Aldh1a3Q9JHW9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Aldh1a3Q9JHW9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Aldh1a3Q9JHW9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Aldh1a3Q9JHW9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Aldh1a3Q9JHW9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Aldh1a3Q9JHW9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Aldh1a3Q9JHW9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Aldh1a3Q9JHW9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Aldh1a3Q9JHW9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Aldh1a3Q9JHW9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Aldh1a3Q9JHW9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Aldh1a3Q9JHW9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Aldh1a3Q9JHW9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Aldh1a3Q9JHW9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Aldh1a3Q9JHW9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Aldh1a3Q9JHW9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Aldh1a3Q9JHW9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Aldh1a3Q9JHW9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Aldh1a3Q9JHW9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Aldh1a3Q9JHW9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Aldh1a3Q9JHW9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aldh1a3Q9JHW9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Aldh1a3Q9JHW9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Aldh1a3Q9JHW9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Aldh1a3Q9JHW9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aldh1a3Q9JHW9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aldh1a3Q9JHW9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Aldh1a3Q9JHW9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Aldh1a3Q9JHW9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Aldh1a3Q9JHW9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aldh1a3Q9JHW9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aldh1a3Q9JHW9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aldh1a3Q9JHW9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aldh1a3Q9JHW9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Aldh1a3Q9JHW9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aldh1a3Q9JHW9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aldh1a3Q9JHW9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Aldh1a3Q9JHW9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aldh1a3Q9JHW9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aldh1a3Q9JHW9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aldh1a3Q9JHW9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aldh1a3Q9JHW9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aldh1a3Q9JHW9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aldh1a3Q9JHW9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Aldh1a3Q9JHW9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Aldh1a3Q9JHW9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Aldh1a3Q9JHW9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aldh1a3Q9JHW9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aldh1a3Q9JHW9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aldh1a3Q9JHW9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Aldh1a3Q9JHW9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aldh1a3Q9JHW9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Aldh1a3Q9JHW9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Aldh1a3Q9JHW9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Aldh1a3Q9JHW9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Aldh1a3Q9JHW9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Aldh1a3Q9JHW9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms