Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

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Length 1,160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aff4Q9ESC8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aff4Q9ESC8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aff4Q9ESC8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aff4Q9ESC8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aff4Q9ESC8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aff4Q9ESC8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aff4Q9ESC8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aff4Q9ESC8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aff4Q9ESC8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aff4Q9ESC8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aff4Q9ESC8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Aff4Q9ESC8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Aff4Q9ESC8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Aff4Q9ESC8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aff4Q9ESC8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aff4Q9ESC8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aff4Q9ESC8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aff4Q9ESC8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aff4Q9ESC8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Aff4Q9ESC8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Aff4Q9ESC8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Aff4Q9ESC8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Aff4Q9ESC8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Aff4Q9ESC8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Aff4Q9ESC8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Aff4Q9ESC8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Aff4Q9ESC8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Aff4Q9ESC8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Aff4Q9ESC8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Aff4Q9ESC8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Aff4Q9ESC8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Aff4Q9ESC8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Aff4Q9ESC8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Aff4Q9ESC8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aff4Q9ESC8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aff4Q9ESC8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Aff4Q9ESC8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Aff4Q9ESC8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Aff4Q9ESC8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Aff4Q9ESC8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Aff4Q9ESC8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Aff4Q9ESC8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Aff4Q9ESC8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Aff4Q9ESC8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aff4Q9ESC8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aff4Q9ESC8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Aff4Q9ESC8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aff4Q9ESC8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aff4Q9ESC8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aff4Q9ESC8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aff4Q9ESC8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Aff4Q9ESC8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aff4Q9ESC8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aff4Q9ESC8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aff4Q9ESC8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aff4Q9ESC8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aff4Q9ESC8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aff4Q9ESC8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aff4Q9ESC8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Aff4Q9ESC8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aff4Q9ESC8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Aff4Q9ESC8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aff4Q9ESC8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aff4Q9ESC8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aff4Q9ESC8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aff4Q9ESC8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aff4Q9ESC8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aff4Q9ESC8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aff4Q9ESC8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aff4Q9ESC8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aff4Q9ESC8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aff4Q9ESC8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aff4Q9ESC8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aff4Q9ESC8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aff4Q9ESC8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Aff4Q9ESC8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aff4Q9ESC8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Aff4Q9ESC8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aff4Q9ESC8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aff4Q9ESC8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Aff4Q9ESC8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Aff4Q9ESC8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Aff4Q9ESC8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aff4Q9ESC8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aff4Q9ESC8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Aff4Q9ESC8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Aff4Q9ESC8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Aff4Q9ESC8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aff4Q9ESC8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aff4Q9ESC8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aff4Q9ESC8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aff4Q9ESC8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aff4Q9ESC8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aff4Q9ESC8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aff4Q9ESC8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aff4Q9ESC8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aff4Q9ESC8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aff4Q9ESC8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aff4Q9ESC8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
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