Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cse1lQ9ERK4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cse1lQ9ERK4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cse1lQ9ERK4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cse1lQ9ERK4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cse1lQ9ERK4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cse1lQ9ERK4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cse1lQ9ERK4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cse1lQ9ERK4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cse1lQ9ERK4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cse1lQ9ERK4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cse1lQ9ERK4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cse1lQ9ERK4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cse1lQ9ERK4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cse1lQ9ERK4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cse1lQ9ERK4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cse1lQ9ERK4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cse1lQ9ERK4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cse1lQ9ERK4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cse1lQ9ERK4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cse1lQ9ERK4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cse1lQ9ERK4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cse1lQ9ERK4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cse1lQ9ERK4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cse1lQ9ERK4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cse1lQ9ERK4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cse1lQ9ERK4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cse1lQ9ERK4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cse1lQ9ERK4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cse1lQ9ERK4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cse1lQ9ERK4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cse1lQ9ERK4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cse1lQ9ERK4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cse1lQ9ERK4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cse1lQ9ERK4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cse1lQ9ERK4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cse1lQ9ERK4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cse1lQ9ERK4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cse1lQ9ERK4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cse1lQ9ERK4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cse1lQ9ERK4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cse1lQ9ERK4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cse1lQ9ERK4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cse1lQ9ERK4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cse1lQ9ERK4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cse1lQ9ERK4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cse1lQ9ERK4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cse1lQ9ERK4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cse1lQ9ERK4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cse1lQ9ERK4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cse1lQ9ERK4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cse1lQ9ERK4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cse1lQ9ERK4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cse1lQ9ERK4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cse1lQ9ERK4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cse1lQ9ERK4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cse1lQ9ERK4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cse1lQ9ERK4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cse1lQ9ERK4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cse1lQ9ERK4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cse1lQ9ERK4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cse1lQ9ERK4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cse1lQ9ERK4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cse1lQ9ERK4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cse1lQ9ERK4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cse1lQ9ERK4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cse1lQ9ERK4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cse1lQ9ERK4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cse1lQ9ERK4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cse1lQ9ERK4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cse1lQ9ERK4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cse1lQ9ERK4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cse1lQ9ERK4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cse1lQ9ERK4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cse1lQ9ERK4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cse1lQ9ERK4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cse1lQ9ERK4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cse1lQ9ERK4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cse1lQ9ERK4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cse1lQ9ERK4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cse1lQ9ERK4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cse1lQ9ERK4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cse1lQ9ERK4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cse1lQ9ERK4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cse1lQ9ERK4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cse1lQ9ERK4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cse1lQ9ERK4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cse1lQ9ERK4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cse1lQ9ERK4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cse1lQ9ERK4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cse1lQ9ERK4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cse1lQ9ERK4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cse1lQ9ERK4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cse1lQ9ERK4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cse1lQ9ERK4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cse1lQ9ERK4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cse1lQ9ERK4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cse1lQ9ERK4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cse1lQ9ERK4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cse1lQ9ERK4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms