Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG2

Strn3, Striatin-3, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn3Q9ERG2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Strn3Q9ERG2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Strn3Q9ERG2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Strn3Q9ERG2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Strn3Q9ERG2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Strn3Q9ERG2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Strn3Q9ERG2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Strn3Q9ERG2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Strn3Q9ERG2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Strn3Q9ERG2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Strn3Q9ERG2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Strn3Q9ERG2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Strn3Q9ERG2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Strn3Q9ERG2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Strn3Q9ERG2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Strn3Q9ERG2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Strn3Q9ERG2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Strn3Q9ERG2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Strn3Q9ERG2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Strn3Q9ERG2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Strn3Q9ERG2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Strn3Q9ERG2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Strn3Q9ERG2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Strn3Q9ERG2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Strn3Q9ERG2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Strn3Q9ERG2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Strn3Q9ERG2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Strn3Q9ERG2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Strn3Q9ERG2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Strn3Q9ERG2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Strn3Q9ERG2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Strn3Q9ERG2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Strn3Q9ERG2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Strn3Q9ERG2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Strn3Q9ERG2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Strn3Q9ERG2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Strn3Q9ERG2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Strn3Q9ERG2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Strn3Q9ERG2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Strn3Q9ERG2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Strn3Q9ERG2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Strn3Q9ERG2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Strn3Q9ERG2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Strn3Q9ERG2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Strn3Q9ERG2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Strn3Q9ERG2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Strn3Q9ERG2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Strn3Q9ERG2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Strn3Q9ERG2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Strn3Q9ERG2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Strn3Q9ERG2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Strn3Q9ERG2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Strn3Q9ERG2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Strn3Q9ERG2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Strn3Q9ERG2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Strn3Q9ERG2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Strn3Q9ERG2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Strn3Q9ERG2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Strn3Q9ERG2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Strn3Q9ERG2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Strn3Q9ERG2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Strn3Q9ERG2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Strn3Q9ERG2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Strn3Q9ERG2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Strn3Q9ERG2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Strn3Q9ERG2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Strn3Q9ERG2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Strn3Q9ERG2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Strn3Q9ERG2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Strn3Q9ERG2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Strn3Q9ERG2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Strn3Q9ERG2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Strn3Q9ERG2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Strn3Q9ERG2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Strn3Q9ERG2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Strn3Q9ERG2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Strn3Q9ERG2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Strn3Q9ERG2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Strn3Q9ERG2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Strn3Q9ERG2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Strn3Q9ERG2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Strn3Q9ERG2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Strn3Q9ERG2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Strn3Q9ERG2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Strn3Q9ERG2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Strn3Q9ERG2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Strn3Q9ERG2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Strn3Q9ERG2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Strn3Q9ERG2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Strn3Q9ERG2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Strn3Q9ERG2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Strn3Q9ERG2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Strn3Q9ERG2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Strn3Q9ERG2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Strn3Q9ERG2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Strn3Q9ERG2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Strn3Q9ERG2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Strn3Q9ERG2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Strn3Q9ERG2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Strn3Q9ERG2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms