Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK8

Trpv4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv4Q9EPK8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpv4Q9EPK8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpv4Q9EPK8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpv4Q9EPK8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpv4Q9EPK8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpv4Q9EPK8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpv4Q9EPK8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpv4Q9EPK8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpv4Q9EPK8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpv4Q9EPK8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpv4Q9EPK8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpv4Q9EPK8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpv4Q9EPK8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpv4Q9EPK8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpv4Q9EPK8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpv4Q9EPK8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpv4Q9EPK8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpv4Q9EPK8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpv4Q9EPK8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpv4Q9EPK8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpv4Q9EPK8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpv4Q9EPK8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpv4Q9EPK8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpv4Q9EPK8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpv4Q9EPK8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpv4Q9EPK8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpv4Q9EPK8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpv4Q9EPK8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpv4Q9EPK8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpv4Q9EPK8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpv4Q9EPK8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpv4Q9EPK8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpv4Q9EPK8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpv4Q9EPK8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpv4Q9EPK8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpv4Q9EPK8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trpv4Q9EPK8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpv4Q9EPK8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpv4Q9EPK8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpv4Q9EPK8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpv4Q9EPK8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpv4Q9EPK8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpv4Q9EPK8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpv4Q9EPK8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpv4Q9EPK8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpv4Q9EPK8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpv4Q9EPK8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpv4Q9EPK8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpv4Q9EPK8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpv4Q9EPK8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpv4Q9EPK8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpv4Q9EPK8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trpv4Q9EPK8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpv4Q9EPK8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpv4Q9EPK8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpv4Q9EPK8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpv4Q9EPK8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpv4Q9EPK8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpv4Q9EPK8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpv4Q9EPK8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpv4Q9EPK8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpv4Q9EPK8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpv4Q9EPK8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpv4Q9EPK8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpv4Q9EPK8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpv4Q9EPK8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpv4Q9EPK8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpv4Q9EPK8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpv4Q9EPK8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpv4Q9EPK8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpv4Q9EPK8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpv4Q9EPK8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpv4Q9EPK8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpv4Q9EPK8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpv4Q9EPK8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpv4Q9EPK8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpv4Q9EPK8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpv4Q9EPK8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpv4Q9EPK8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpv4Q9EPK8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpv4Q9EPK8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpv4Q9EPK8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trpv4Q9EPK8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpv4Q9EPK8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpv4Q9EPK8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpv4Q9EPK8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpv4Q9EPK8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpv4Q9EPK8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpv4Q9EPK8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpv4Q9EPK8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpv4Q9EPK8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpv4Q9EPK8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpv4Q9EPK8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpv4Q9EPK8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpv4Q9EPK8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpv4Q9EPK8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpv4Q9EPK8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpv4Q9EPK8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpv4Q9EPK8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpv4Q9EPK8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 208.4 ms