Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP79

Vmn1r52, Vomeronasal type-1 receptor 52, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r52Q9EP79 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r52Q9EP79 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r52Q9EP79 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r52Q9EP79 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r52Q9EP79 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r52Q9EP79 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r52Q9EP79 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r52Q9EP79 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r52Q9EP79 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r52Q9EP79 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r52Q9EP79 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r52Q9EP79 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r52Q9EP79 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r52Q9EP79 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r52Q9EP79 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r52Q9EP79 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r52Q9EP79 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r52Q9EP79 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r52Q9EP79 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r52Q9EP79 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r52Q9EP79 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r52Q9EP79 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r52Q9EP79 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vmn1r52Q9EP79 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r52Q9EP79 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r52Q9EP79 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r52Q9EP79 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r52Q9EP79 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r52Q9EP79 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r52Q9EP79 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r52Q9EP79 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r52Q9EP79 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r52Q9EP79 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r52Q9EP79 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r52Q9EP79 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r52Q9EP79 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r52Q9EP79 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r52Q9EP79 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r52Q9EP79 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r52Q9EP79 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r52Q9EP79 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r52Q9EP79 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r52Q9EP79 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r52Q9EP79 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r52Q9EP79 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r52Q9EP79 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vmn1r52Q9EP79 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vmn1r52Q9EP79 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r52Q9EP79 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r52Q9EP79 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r52Q9EP79 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r52Q9EP79 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r52Q9EP79 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r52Q9EP79 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r52Q9EP79 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r52Q9EP79 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r52Q9EP79 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r52Q9EP79 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r52Q9EP79 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r52Q9EP79 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r52Q9EP79 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r52Q9EP79 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r52Q9EP79 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r52Q9EP79 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r52Q9EP79 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r52Q9EP79 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r52Q9EP79 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r52Q9EP79 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r52Q9EP79 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r52Q9EP79 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r52Q9EP79 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r52Q9EP79 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r52Q9EP79 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r52Q9EP79 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r52Q9EP79 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r52Q9EP79 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r52Q9EP79 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r52Q9EP79 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r52Q9EP79 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r52Q9EP79 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r52Q9EP79 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r52Q9EP79 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r52Q9EP79 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r52Q9EP79 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r52Q9EP79 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r52Q9EP79 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r52Q9EP79 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r52Q9EP79 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r52Q9EP79 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r52Q9EP79 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r52Q9EP79 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r52Q9EP79 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r52Q9EP79 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r52Q9EP79 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r52Q9EP79 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r52Q9EP79 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r52Q9EP79 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r52Q9EP79 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r52Q9EP79 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r52Q9EP79 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms