Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ndufa8Q9DCJ5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ndufa8Q9DCJ5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ndufa8Q9DCJ5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ndufa8Q9DCJ5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ndufa8Q9DCJ5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ndufa8Q9DCJ5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ndufa8Q9DCJ5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ndufa8Q9DCJ5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ndufa8Q9DCJ5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ndufa8Q9DCJ5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ndufa8Q9DCJ5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ndufa8Q9DCJ5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ndufa8Q9DCJ5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ndufa8Q9DCJ5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ndufa8Q9DCJ5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ndufa8Q9DCJ5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ndufa8Q9DCJ5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ndufa8Q9DCJ5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ndufa8Q9DCJ5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ndufa8Q9DCJ5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ndufa8Q9DCJ5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ndufa8Q9DCJ5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ndufa8Q9DCJ5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ndufa8Q9DCJ5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ndufa8Q9DCJ5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ndufa8Q9DCJ5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ndufa8Q9DCJ5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ndufa8Q9DCJ5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ndufa8Q9DCJ5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ndufa8Q9DCJ5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ndufa8Q9DCJ5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ndufa8Q9DCJ5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ndufa8Q9DCJ5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ndufa8Q9DCJ5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ndufa8Q9DCJ5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ndufa8Q9DCJ5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ndufa8Q9DCJ5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ndufa8Q9DCJ5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ndufa8Q9DCJ5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ndufa8Q9DCJ5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ndufa8Q9DCJ5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ndufa8Q9DCJ5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ndufa8Q9DCJ5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ndufa8Q9DCJ5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ndufa8Q9DCJ5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ndufa8Q9DCJ5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ndufa8Q9DCJ5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ndufa8Q9DCJ5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ndufa8Q9DCJ5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ndufa8Q9DCJ5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ndufa8Q9DCJ5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ndufa8Q9DCJ5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ndufa8Q9DCJ5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ndufa8Q9DCJ5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ndufa8Q9DCJ5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ndufa8Q9DCJ5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ndufa8Q9DCJ5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ndufa8Q9DCJ5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ndufa8Q9DCJ5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ndufa8Q9DCJ5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ndufa8Q9DCJ5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ndufa8Q9DCJ5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ndufa8Q9DCJ5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ndufa8Q9DCJ5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ndufa8Q9DCJ5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ndufa8Q9DCJ5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ndufa8Q9DCJ5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ndufa8Q9DCJ5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ndufa8Q9DCJ5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ndufa8Q9DCJ5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ndufa8Q9DCJ5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ndufa8Q9DCJ5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ndufa8Q9DCJ5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ndufa8Q9DCJ5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ndufa8Q9DCJ5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ndufa8Q9DCJ5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ndufa8Q9DCJ5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ndufa8Q9DCJ5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ndufa8Q9DCJ5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ndufa8Q9DCJ5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ndufa8Q9DCJ5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ndufa8Q9DCJ5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ndufa8Q9DCJ5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ndufa8Q9DCJ5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ndufa8Q9DCJ5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ndufa8Q9DCJ5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ndufa8Q9DCJ5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ndufa8Q9DCJ5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ndufa8Q9DCJ5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ndufa8Q9DCJ5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ndufa8Q9DCJ5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ndufa8Q9DCJ5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ndufa8Q9DCJ5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ndufa8Q9DCJ5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ndufa8Q9DCJ5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ndufa8Q9DCJ5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ndufa8Q9DCJ5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ndufa8Q9DCJ5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms