Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hmg20aQ9DC33 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hmg20aQ9DC33 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmg20aQ9DC33 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hmg20aQ9DC33 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmg20aQ9DC33 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmg20aQ9DC33 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmg20aQ9DC33 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmg20aQ9DC33 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hmg20aQ9DC33 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmg20aQ9DC33 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hmg20aQ9DC33 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmg20aQ9DC33 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmg20aQ9DC33 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hmg20aQ9DC33 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hmg20aQ9DC33 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmg20aQ9DC33 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmg20aQ9DC33 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmg20aQ9DC33 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hmg20aQ9DC33 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms