Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cbx6Q9DBY5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cbx6Q9DBY5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cbx6Q9DBY5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cbx6Q9DBY5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cbx6Q9DBY5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cbx6Q9DBY5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cbx6Q9DBY5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cbx6Q9DBY5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cbx6Q9DBY5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cbx6Q9DBY5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cbx6Q9DBY5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cbx6Q9DBY5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cbx6Q9DBY5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cbx6Q9DBY5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cbx6Q9DBY5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cbx6Q9DBY5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cbx6Q9DBY5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cbx6Q9DBY5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cbx6Q9DBY5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cbx6Q9DBY5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cbx6Q9DBY5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cbx6Q9DBY5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cbx6Q9DBY5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cbx6Q9DBY5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cbx6Q9DBY5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cbx6Q9DBY5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cbx6Q9DBY5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cbx6Q9DBY5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cbx6Q9DBY5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cbx6Q9DBY5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cbx6Q9DBY5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cbx6Q9DBY5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cbx6Q9DBY5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cbx6Q9DBY5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Cbx6Q9DBY5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cbx6Q9DBY5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cbx6Q9DBY5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Cbx6Q9DBY5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cbx6Q9DBY5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cbx6Q9DBY5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cbx6Q9DBY5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cbx6Q9DBY5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cbx6Q9DBY5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cbx6Q9DBY5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cbx6Q9DBY5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cbx6Q9DBY5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cbx6Q9DBY5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cbx6Q9DBY5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cbx6Q9DBY5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cbx6Q9DBY5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Cbx6Q9DBY5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cbx6Q9DBY5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cbx6Q9DBY5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Cbx6Q9DBY5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Cbx6Q9DBY5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cbx6Q9DBY5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cbx6Q9DBY5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cbx6Q9DBY5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cbx6Q9DBY5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cbx6Q9DBY5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cbx6Q9DBY5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cbx6Q9DBY5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cbx6Q9DBY5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cbx6Q9DBY5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cbx6Q9DBY5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cbx6Q9DBY5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cbx6Q9DBY5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cbx6Q9DBY5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cbx6Q9DBY5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cbx6Q9DBY5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cbx6Q9DBY5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cbx6Q9DBY5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cbx6Q9DBY5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cbx6Q9DBY5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cbx6Q9DBY5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cbx6Q9DBY5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cbx6Q9DBY5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cbx6Q9DBY5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Cbx6Q9DBY5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Cbx6Q9DBY5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Cbx6Q9DBY5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cbx6Q9DBY5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cbx6Q9DBY5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cbx6Q9DBY5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cbx6Q9DBY5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cbx6Q9DBY5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cbx6Q9DBY5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cbx6Q9DBY5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cbx6Q9DBY5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cbx6Q9DBY5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cbx6Q9DBY5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cbx6Q9DBY5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cbx6Q9DBY5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cbx6Q9DBY5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cbx6Q9DBY5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cbx6Q9DBY5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cbx6Q9DBY5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Cbx6Q9DBY5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cbx6Q9DBY5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms