Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cmtm2aQ9DAR1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cmtm2aQ9DAR1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm2aQ9DAR1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm2aQ9DAR1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm2aQ9DAR1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm2aQ9DAR1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm2aQ9DAR1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cmtm2aQ9DAR1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cmtm2aQ9DAR1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cmtm2aQ9DAR1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cmtm2aQ9DAR1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cmtm2aQ9DAR1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cmtm2aQ9DAR1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cmtm2aQ9DAR1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cmtm2aQ9DAR1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cmtm2aQ9DAR1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cmtm2aQ9DAR1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cmtm2aQ9DAR1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cmtm2aQ9DAR1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cmtm2aQ9DAR1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmtm2aQ9DAR1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmtm2aQ9DAR1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cmtm2aQ9DAR1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cmtm2aQ9DAR1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cmtm2aQ9DAR1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cmtm2aQ9DAR1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cmtm2aQ9DAR1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cmtm2aQ9DAR1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cmtm2aQ9DAR1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cmtm2aQ9DAR1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cmtm2aQ9DAR1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cmtm2aQ9DAR1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cmtm2aQ9DAR1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cmtm2aQ9DAR1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cmtm2aQ9DAR1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cmtm2aQ9DAR1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cmtm2aQ9DAR1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cmtm2aQ9DAR1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cmtm2aQ9DAR1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cmtm2aQ9DAR1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cmtm2aQ9DAR1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cmtm2aQ9DAR1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cmtm2aQ9DAR1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cmtm2aQ9DAR1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cmtm2aQ9DAR1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cmtm2aQ9DAR1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cmtm2aQ9DAR1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cmtm2aQ9DAR1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cmtm2aQ9DAR1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cmtm2aQ9DAR1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cmtm2aQ9DAR1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cmtm2aQ9DAR1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cmtm2aQ9DAR1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cmtm2aQ9DAR1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cmtm2aQ9DAR1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cmtm2aQ9DAR1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cmtm2aQ9DAR1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cmtm2aQ9DAR1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cmtm2aQ9DAR1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cmtm2aQ9DAR1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cmtm2aQ9DAR1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cmtm2aQ9DAR1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cmtm2aQ9DAR1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cmtm2aQ9DAR1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cmtm2aQ9DAR1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cmtm2aQ9DAR1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cmtm2aQ9DAR1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cmtm2aQ9DAR1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cmtm2aQ9DAR1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cmtm2aQ9DAR1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cmtm2aQ9DAR1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cmtm2aQ9DAR1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cmtm2aQ9DAR1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cmtm2aQ9DAR1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cmtm2aQ9DAR1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cmtm2aQ9DAR1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cmtm2aQ9DAR1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cmtm2aQ9DAR1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cmtm2aQ9DAR1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cmtm2aQ9DAR1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cmtm2aQ9DAR1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cmtm2aQ9DAR1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cmtm2aQ9DAR1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cmtm2aQ9DAR1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cmtm2aQ9DAR1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cmtm2aQ9DAR1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cmtm2aQ9DAR1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cmtm2aQ9DAR1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cmtm2aQ9DAR1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cmtm2aQ9DAR1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cmtm2aQ9DAR1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cmtm2aQ9DAR1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cmtm2aQ9DAR1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cmtm2aQ9DAR1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cmtm2aQ9DAR1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cmtm2aQ9DAR1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cmtm2aQ9DAR1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cmtm2aQ9DAR1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.7 ms