Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Asf1bQ9DAP7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Asf1bQ9DAP7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Asf1bQ9DAP7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Asf1bQ9DAP7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Asf1bQ9DAP7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Asf1bQ9DAP7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Asf1bQ9DAP7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Asf1bQ9DAP7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Asf1bQ9DAP7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Asf1bQ9DAP7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Asf1bQ9DAP7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Asf1bQ9DAP7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Asf1bQ9DAP7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Asf1bQ9DAP7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Asf1bQ9DAP7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Asf1bQ9DAP7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Asf1bQ9DAP7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Asf1bQ9DAP7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Asf1bQ9DAP7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Asf1bQ9DAP7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Asf1bQ9DAP7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Asf1bQ9DAP7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Asf1bQ9DAP7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Asf1bQ9DAP7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Asf1bQ9DAP7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Asf1bQ9DAP7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Asf1bQ9DAP7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Asf1bQ9DAP7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Asf1bQ9DAP7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Asf1bQ9DAP7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Asf1bQ9DAP7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Asf1bQ9DAP7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Asf1bQ9DAP7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Asf1bQ9DAP7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.33■■□□□ 1
Asf1bQ9DAP7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Asf1bQ9DAP7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Asf1bQ9DAP7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Asf1bQ9DAP7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Asf1bQ9DAP7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Asf1bQ9DAP7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Asf1bQ9DAP7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Asf1bQ9DAP7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Asf1bQ9DAP7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Asf1bQ9DAP7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Asf1bQ9DAP7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Asf1bQ9DAP7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Asf1bQ9DAP7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Asf1bQ9DAP7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Asf1bQ9DAP7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Asf1bQ9DAP7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Asf1bQ9DAP7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Asf1bQ9DAP7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Asf1bQ9DAP7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Asf1bQ9DAP7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Asf1bQ9DAP7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Asf1bQ9DAP7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Asf1bQ9DAP7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Asf1bQ9DAP7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Asf1bQ9DAP7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Asf1bQ9DAP7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Asf1bQ9DAP7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Asf1bQ9DAP7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Asf1bQ9DAP7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Asf1bQ9DAP7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Asf1bQ9DAP7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Asf1bQ9DAP7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Asf1bQ9DAP7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Asf1bQ9DAP7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Asf1bQ9DAP7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Asf1bQ9DAP7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Asf1bQ9DAP7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Asf1bQ9DAP7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Asf1bQ9DAP7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Asf1bQ9DAP7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Asf1bQ9DAP7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Asf1bQ9DAP7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Asf1bQ9DAP7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Asf1bQ9DAP7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Asf1bQ9DAP7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Asf1bQ9DAP7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Asf1bQ9DAP7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Asf1bQ9DAP7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Asf1bQ9DAP7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Asf1bQ9DAP7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Asf1bQ9DAP7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Asf1bQ9DAP7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Asf1bQ9DAP7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Asf1bQ9DAP7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Asf1bQ9DAP7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Asf1bQ9DAP7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Asf1bQ9DAP7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Asf1bQ9DAP7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Asf1bQ9DAP7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Asf1bQ9DAP7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Asf1bQ9DAP7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Asf1bQ9DAP7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Asf1bQ9DAP7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Asf1bQ9DAP7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Asf1bQ9DAP7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms