Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9DA42 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9DA42 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9DA42 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9DA42 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9DA42 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9DA42 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9DA42 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9DA42 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9DA42 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9DA42 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9DA42 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9DA42 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9DA42 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9DA42 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9DA42 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9DA42 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9DA42 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9DA42 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9DA42 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9DA42 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9DA42 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Q9DA42 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Q9DA42 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Q9DA42 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9DA42 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9DA42 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9DA42 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9DA42 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9DA42 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9DA42 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9DA42 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9DA42 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9DA42 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9DA42 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9DA42 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9DA42 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9DA42 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9DA42 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9DA42 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9DA42 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9DA42 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9DA42 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9DA42 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9DA42 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9DA42 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9DA42 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9DA42 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9DA42 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9DA42 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9DA42 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9DA42 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9DA42 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9DA42 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9DA42 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9DA42 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9DA42 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9DA42 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9DA42 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9DA42 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9DA42 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9DA42 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9DA42 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9DA42 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q9DA42 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9DA42 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9DA42 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9DA42 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9DA42 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9DA42 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9DA42 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9DA42 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9DA42 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9DA42 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9DA42 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9DA42 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9DA42 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9DA42 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9DA42 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9DA42 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9DA42 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9DA42 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9DA42 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9DA42 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9DA42 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9DA42 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9DA42 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9DA42 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9DA42 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9DA42 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9DA42 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Q9DA42 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Q9DA42 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9DA42 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9DA42 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9DA42 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9DA42 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9DA42 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9DA42 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9DA42 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms