Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Subh2bvQ9D9Z7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Subh2bvQ9D9Z7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Subh2bvQ9D9Z7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Subh2bvQ9D9Z7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Subh2bvQ9D9Z7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Subh2bvQ9D9Z7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Subh2bvQ9D9Z7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Subh2bvQ9D9Z7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Subh2bvQ9D9Z7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Subh2bvQ9D9Z7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Subh2bvQ9D9Z7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Subh2bvQ9D9Z7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Subh2bvQ9D9Z7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Subh2bvQ9D9Z7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Subh2bvQ9D9Z7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Subh2bvQ9D9Z7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Subh2bvQ9D9Z7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Subh2bvQ9D9Z7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Subh2bvQ9D9Z7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Subh2bvQ9D9Z7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Subh2bvQ9D9Z7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Subh2bvQ9D9Z7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Subh2bvQ9D9Z7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Subh2bvQ9D9Z7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Subh2bvQ9D9Z7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Subh2bvQ9D9Z7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Subh2bvQ9D9Z7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Subh2bvQ9D9Z7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Subh2bvQ9D9Z7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Subh2bvQ9D9Z7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Subh2bvQ9D9Z7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Subh2bvQ9D9Z7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Subh2bvQ9D9Z7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Subh2bvQ9D9Z7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Subh2bvQ9D9Z7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Subh2bvQ9D9Z7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Subh2bvQ9D9Z7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Subh2bvQ9D9Z7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Subh2bvQ9D9Z7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Subh2bvQ9D9Z7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Subh2bvQ9D9Z7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Subh2bvQ9D9Z7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Subh2bvQ9D9Z7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Subh2bvQ9D9Z7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Subh2bvQ9D9Z7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Subh2bvQ9D9Z7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Subh2bvQ9D9Z7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Subh2bvQ9D9Z7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Subh2bvQ9D9Z7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Subh2bvQ9D9Z7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Subh2bvQ9D9Z7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Subh2bvQ9D9Z7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Subh2bvQ9D9Z7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Subh2bvQ9D9Z7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Subh2bvQ9D9Z7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Subh2bvQ9D9Z7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Subh2bvQ9D9Z7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Subh2bvQ9D9Z7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Subh2bvQ9D9Z7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Subh2bvQ9D9Z7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Subh2bvQ9D9Z7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Subh2bvQ9D9Z7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Subh2bvQ9D9Z7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Subh2bvQ9D9Z7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Subh2bvQ9D9Z7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Subh2bvQ9D9Z7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Subh2bvQ9D9Z7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Subh2bvQ9D9Z7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Subh2bvQ9D9Z7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Subh2bvQ9D9Z7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Subh2bvQ9D9Z7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Subh2bvQ9D9Z7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Subh2bvQ9D9Z7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Subh2bvQ9D9Z7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Subh2bvQ9D9Z7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Subh2bvQ9D9Z7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Subh2bvQ9D9Z7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Subh2bvQ9D9Z7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Subh2bvQ9D9Z7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Subh2bvQ9D9Z7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Subh2bvQ9D9Z7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Subh2bvQ9D9Z7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Subh2bvQ9D9Z7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Subh2bvQ9D9Z7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Subh2bvQ9D9Z7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Subh2bvQ9D9Z7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Subh2bvQ9D9Z7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms