Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X2

Ccdc124, Coiled-coil domain-containing protein 124, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc124Q9D8X2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc124Q9D8X2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc124Q9D8X2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc124Q9D8X2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc124Q9D8X2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc124Q9D8X2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc124Q9D8X2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc124Q9D8X2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc124Q9D8X2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc124Q9D8X2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc124Q9D8X2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc124Q9D8X2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc124Q9D8X2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc124Q9D8X2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc124Q9D8X2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc124Q9D8X2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc124Q9D8X2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc124Q9D8X2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc124Q9D8X2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc124Q9D8X2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc124Q9D8X2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc124Q9D8X2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc124Q9D8X2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc124Q9D8X2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc124Q9D8X2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc124Q9D8X2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc124Q9D8X2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc124Q9D8X2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc124Q9D8X2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc124Q9D8X2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc124Q9D8X2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc124Q9D8X2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc124Q9D8X2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc124Q9D8X2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc124Q9D8X2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc124Q9D8X2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc124Q9D8X2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc124Q9D8X2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc124Q9D8X2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc124Q9D8X2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc124Q9D8X2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc124Q9D8X2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc124Q9D8X2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc124Q9D8X2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc124Q9D8X2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc124Q9D8X2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc124Q9D8X2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc124Q9D8X2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc124Q9D8X2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc124Q9D8X2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc124Q9D8X2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc124Q9D8X2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc124Q9D8X2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc124Q9D8X2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc124Q9D8X2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc124Q9D8X2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc124Q9D8X2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc124Q9D8X2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc124Q9D8X2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc124Q9D8X2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc124Q9D8X2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc124Q9D8X2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc124Q9D8X2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc124Q9D8X2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc124Q9D8X2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc124Q9D8X2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc124Q9D8X2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc124Q9D8X2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc124Q9D8X2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc124Q9D8X2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc124Q9D8X2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc124Q9D8X2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc124Q9D8X2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc124Q9D8X2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc124Q9D8X2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc124Q9D8X2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc124Q9D8X2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc124Q9D8X2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc124Q9D8X2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc124Q9D8X2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc124Q9D8X2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc124Q9D8X2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc124Q9D8X2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc124Q9D8X2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc124Q9D8X2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc124Q9D8X2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc124Q9D8X2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc124Q9D8X2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc124Q9D8X2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc124Q9D8X2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc124Q9D8X2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc124Q9D8X2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc124Q9D8X2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc124Q9D8X2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc124Q9D8X2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc124Q9D8X2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc124Q9D8X2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc124Q9D8X2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc124Q9D8X2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc124Q9D8X2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms