Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U2

Tmem41a, Transmembrane protein 41A, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem41aQ9D8U2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem41aQ9D8U2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmem41aQ9D8U2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmem41aQ9D8U2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmem41aQ9D8U2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem41aQ9D8U2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem41aQ9D8U2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem41aQ9D8U2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem41aQ9D8U2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem41aQ9D8U2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem41aQ9D8U2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem41aQ9D8U2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem41aQ9D8U2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem41aQ9D8U2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem41aQ9D8U2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem41aQ9D8U2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem41aQ9D8U2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem41aQ9D8U2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem41aQ9D8U2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem41aQ9D8U2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem41aQ9D8U2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem41aQ9D8U2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem41aQ9D8U2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem41aQ9D8U2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem41aQ9D8U2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem41aQ9D8U2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem41aQ9D8U2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem41aQ9D8U2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem41aQ9D8U2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem41aQ9D8U2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem41aQ9D8U2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem41aQ9D8U2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem41aQ9D8U2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem41aQ9D8U2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem41aQ9D8U2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem41aQ9D8U2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem41aQ9D8U2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem41aQ9D8U2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem41aQ9D8U2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem41aQ9D8U2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem41aQ9D8U2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem41aQ9D8U2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem41aQ9D8U2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem41aQ9D8U2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem41aQ9D8U2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem41aQ9D8U2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem41aQ9D8U2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem41aQ9D8U2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem41aQ9D8U2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem41aQ9D8U2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem41aQ9D8U2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem41aQ9D8U2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem41aQ9D8U2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem41aQ9D8U2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem41aQ9D8U2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem41aQ9D8U2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem41aQ9D8U2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem41aQ9D8U2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem41aQ9D8U2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem41aQ9D8U2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem41aQ9D8U2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem41aQ9D8U2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem41aQ9D8U2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem41aQ9D8U2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem41aQ9D8U2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem41aQ9D8U2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem41aQ9D8U2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem41aQ9D8U2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem41aQ9D8U2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem41aQ9D8U2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem41aQ9D8U2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem41aQ9D8U2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem41aQ9D8U2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem41aQ9D8U2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem41aQ9D8U2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem41aQ9D8U2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem41aQ9D8U2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem41aQ9D8U2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem41aQ9D8U2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem41aQ9D8U2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem41aQ9D8U2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem41aQ9D8U2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem41aQ9D8U2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem41aQ9D8U2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem41aQ9D8U2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem41aQ9D8U2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem41aQ9D8U2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem41aQ9D8U2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem41aQ9D8U2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem41aQ9D8U2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem41aQ9D8U2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem41aQ9D8U2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem41aQ9D8U2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem41aQ9D8U2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem41aQ9D8U2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem41aQ9D8U2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem41aQ9D8U2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem41aQ9D8U2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem41aQ9D8U2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem41aQ9D8U2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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