Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc91Q9D8L5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc91Q9D8L5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc91Q9D8L5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc91Q9D8L5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc91Q9D8L5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc91Q9D8L5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc91Q9D8L5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc91Q9D8L5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc91Q9D8L5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc91Q9D8L5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc91Q9D8L5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc91Q9D8L5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc91Q9D8L5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc91Q9D8L5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc91Q9D8L5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc91Q9D8L5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc91Q9D8L5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc91Q9D8L5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc91Q9D8L5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc91Q9D8L5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc91Q9D8L5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc91Q9D8L5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc91Q9D8L5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc91Q9D8L5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc91Q9D8L5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc91Q9D8L5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc91Q9D8L5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc91Q9D8L5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc91Q9D8L5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc91Q9D8L5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc91Q9D8L5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc91Q9D8L5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc91Q9D8L5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc91Q9D8L5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc91Q9D8L5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc91Q9D8L5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc91Q9D8L5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc91Q9D8L5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc91Q9D8L5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc91Q9D8L5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc91Q9D8L5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc91Q9D8L5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc91Q9D8L5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc91Q9D8L5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc91Q9D8L5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc91Q9D8L5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc91Q9D8L5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc91Q9D8L5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc91Q9D8L5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc91Q9D8L5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc91Q9D8L5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc91Q9D8L5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc91Q9D8L5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc91Q9D8L5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc91Q9D8L5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc91Q9D8L5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc91Q9D8L5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc91Q9D8L5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc91Q9D8L5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc91Q9D8L5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc91Q9D8L5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc91Q9D8L5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc91Q9D8L5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc91Q9D8L5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc91Q9D8L5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc91Q9D8L5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc91Q9D8L5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc91Q9D8L5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc91Q9D8L5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc91Q9D8L5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc91Q9D8L5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc91Q9D8L5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc91Q9D8L5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc91Q9D8L5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc91Q9D8L5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc91Q9D8L5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc91Q9D8L5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc91Q9D8L5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc91Q9D8L5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc91Q9D8L5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc91Q9D8L5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc91Q9D8L5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc91Q9D8L5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc91Q9D8L5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc91Q9D8L5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc91Q9D8L5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc91Q9D8L5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc91Q9D8L5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc91Q9D8L5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc91Q9D8L5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc91Q9D8L5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc91Q9D8L5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc91Q9D8L5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc91Q9D8L5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc91Q9D8L5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc91Q9D8L5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc91Q9D8L5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc91Q9D8L5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc91Q9D8L5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms