Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Jam3Q9D8B7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Jam3Q9D8B7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Jam3Q9D8B7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Jam3Q9D8B7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Jam3Q9D8B7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Jam3Q9D8B7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Jam3Q9D8B7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Jam3Q9D8B7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Jam3Q9D8B7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Jam3Q9D8B7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Jam3Q9D8B7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Jam3Q9D8B7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Jam3Q9D8B7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Jam3Q9D8B7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Jam3Q9D8B7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Jam3Q9D8B7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Jam3Q9D8B7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Jam3Q9D8B7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Jam3Q9D8B7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Jam3Q9D8B7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Jam3Q9D8B7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Jam3Q9D8B7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Jam3Q9D8B7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Jam3Q9D8B7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Jam3Q9D8B7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Jam3Q9D8B7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Jam3Q9D8B7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Jam3Q9D8B7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Jam3Q9D8B7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Jam3Q9D8B7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Jam3Q9D8B7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Jam3Q9D8B7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Jam3Q9D8B7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Jam3Q9D8B7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Jam3Q9D8B7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Jam3Q9D8B7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Jam3Q9D8B7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Jam3Q9D8B7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Jam3Q9D8B7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Jam3Q9D8B7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Jam3Q9D8B7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Jam3Q9D8B7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Jam3Q9D8B7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Jam3Q9D8B7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Jam3Q9D8B7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Jam3Q9D8B7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Jam3Q9D8B7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Jam3Q9D8B7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Jam3Q9D8B7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Jam3Q9D8B7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Jam3Q9D8B7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Jam3Q9D8B7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Jam3Q9D8B7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Jam3Q9D8B7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Jam3Q9D8B7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Jam3Q9D8B7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Jam3Q9D8B7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Jam3Q9D8B7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Jam3Q9D8B7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Jam3Q9D8B7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Jam3Q9D8B7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Jam3Q9D8B7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Jam3Q9D8B7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Jam3Q9D8B7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Jam3Q9D8B7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Jam3Q9D8B7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Jam3Q9D8B7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Jam3Q9D8B7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Jam3Q9D8B7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Jam3Q9D8B7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Jam3Q9D8B7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Jam3Q9D8B7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Jam3Q9D8B7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Jam3Q9D8B7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Jam3Q9D8B7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Jam3Q9D8B7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Jam3Q9D8B7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Jam3Q9D8B7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Jam3Q9D8B7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Jam3Q9D8B7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Jam3Q9D8B7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Jam3Q9D8B7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Jam3Q9D8B7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Jam3Q9D8B7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Jam3Q9D8B7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Jam3Q9D8B7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Jam3Q9D8B7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Jam3Q9D8B7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Jam3Q9D8B7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Jam3Q9D8B7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Jam3Q9D8B7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Jam3Q9D8B7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Jam3Q9D8B7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Jam3Q9D8B7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Jam3Q9D8B7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Jam3Q9D8B7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Jam3Q9D8B7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Jam3Q9D8B7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Jam3Q9D8B7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms