Protein–RNA interactions for Protein: Q9D842

Aplf, Aprataxin and PNK-like factor, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AplfQ9D842 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AplfQ9D842 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AplfQ9D842 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AplfQ9D842 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AplfQ9D842 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AplfQ9D842 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AplfQ9D842 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AplfQ9D842 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AplfQ9D842 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AplfQ9D842 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AplfQ9D842 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AplfQ9D842 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AplfQ9D842 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AplfQ9D842 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AplfQ9D842 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AplfQ9D842 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AplfQ9D842 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AplfQ9D842 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AplfQ9D842 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AplfQ9D842 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AplfQ9D842 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AplfQ9D842 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
AplfQ9D842 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AplfQ9D842 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AplfQ9D842 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
AplfQ9D842 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AplfQ9D842 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AplfQ9D842 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AplfQ9D842 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AplfQ9D842 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AplfQ9D842 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AplfQ9D842 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AplfQ9D842 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AplfQ9D842 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AplfQ9D842 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
AplfQ9D842 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AplfQ9D842 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AplfQ9D842 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AplfQ9D842 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AplfQ9D842 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AplfQ9D842 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AplfQ9D842 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AplfQ9D842 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AplfQ9D842 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AplfQ9D842 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AplfQ9D842 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AplfQ9D842 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AplfQ9D842 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AplfQ9D842 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AplfQ9D842 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AplfQ9D842 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AplfQ9D842 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AplfQ9D842 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AplfQ9D842 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AplfQ9D842 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AplfQ9D842 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AplfQ9D842 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AplfQ9D842 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AplfQ9D842 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AplfQ9D842 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AplfQ9D842 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AplfQ9D842 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AplfQ9D842 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AplfQ9D842 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AplfQ9D842 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AplfQ9D842 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AplfQ9D842 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AplfQ9D842 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
AplfQ9D842 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AplfQ9D842 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AplfQ9D842 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AplfQ9D842 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AplfQ9D842 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AplfQ9D842 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AplfQ9D842 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AplfQ9D842 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AplfQ9D842 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AplfQ9D842 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AplfQ9D842 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AplfQ9D842 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AplfQ9D842 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AplfQ9D842 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AplfQ9D842 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AplfQ9D842 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AplfQ9D842 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AplfQ9D842 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AplfQ9D842 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AplfQ9D842 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
AplfQ9D842 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AplfQ9D842 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AplfQ9D842 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AplfQ9D842 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AplfQ9D842 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AplfQ9D842 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AplfQ9D842 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AplfQ9D842 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AplfQ9D842 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AplfQ9D842 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AplfQ9D842 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AplfQ9D842 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms