Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Slx4ipQ9D7Y9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Slx4ipQ9D7Y9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Slx4ipQ9D7Y9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Slx4ipQ9D7Y9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slx4ipQ9D7Y9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slx4ipQ9D7Y9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Slx4ipQ9D7Y9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slx4ipQ9D7Y9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slx4ipQ9D7Y9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slx4ipQ9D7Y9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slx4ipQ9D7Y9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slx4ipQ9D7Y9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slx4ipQ9D7Y9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slx4ipQ9D7Y9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slx4ipQ9D7Y9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slx4ipQ9D7Y9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slx4ipQ9D7Y9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slx4ipQ9D7Y9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slx4ipQ9D7Y9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slx4ipQ9D7Y9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Slx4ipQ9D7Y9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slx4ipQ9D7Y9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slx4ipQ9D7Y9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slx4ipQ9D7Y9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slx4ipQ9D7Y9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slx4ipQ9D7Y9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slx4ipQ9D7Y9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slx4ipQ9D7Y9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slx4ipQ9D7Y9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slx4ipQ9D7Y9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slx4ipQ9D7Y9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slx4ipQ9D7Y9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slx4ipQ9D7Y9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slx4ipQ9D7Y9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slx4ipQ9D7Y9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slx4ipQ9D7Y9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slx4ipQ9D7Y9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slx4ipQ9D7Y9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slx4ipQ9D7Y9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slx4ipQ9D7Y9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slx4ipQ9D7Y9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slx4ipQ9D7Y9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slx4ipQ9D7Y9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slx4ipQ9D7Y9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slx4ipQ9D7Y9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slx4ipQ9D7Y9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slx4ipQ9D7Y9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slx4ipQ9D7Y9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slx4ipQ9D7Y9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slx4ipQ9D7Y9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slx4ipQ9D7Y9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slx4ipQ9D7Y9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slx4ipQ9D7Y9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slx4ipQ9D7Y9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slx4ipQ9D7Y9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slx4ipQ9D7Y9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slx4ipQ9D7Y9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slx4ipQ9D7Y9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slx4ipQ9D7Y9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slx4ipQ9D7Y9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slx4ipQ9D7Y9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slx4ipQ9D7Y9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slx4ipQ9D7Y9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slx4ipQ9D7Y9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slx4ipQ9D7Y9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slx4ipQ9D7Y9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slx4ipQ9D7Y9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Slx4ipQ9D7Y9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Slx4ipQ9D7Y9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Slx4ipQ9D7Y9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slx4ipQ9D7Y9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slx4ipQ9D7Y9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slx4ipQ9D7Y9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slx4ipQ9D7Y9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slx4ipQ9D7Y9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slx4ipQ9D7Y9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slx4ipQ9D7Y9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slx4ipQ9D7Y9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slx4ipQ9D7Y9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slx4ipQ9D7Y9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slx4ipQ9D7Y9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slx4ipQ9D7Y9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slx4ipQ9D7Y9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slx4ipQ9D7Y9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Slx4ipQ9D7Y9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Slx4ipQ9D7Y9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Slx4ipQ9D7Y9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Slx4ipQ9D7Y9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slx4ipQ9D7Y9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slx4ipQ9D7Y9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slx4ipQ9D7Y9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slx4ipQ9D7Y9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slx4ipQ9D7Y9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slx4ipQ9D7Y9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slx4ipQ9D7Y9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms