Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tspan17Q9D7W4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tspan17Q9D7W4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tspan17Q9D7W4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tspan17Q9D7W4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Tspan17Q9D7W4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tspan17Q9D7W4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tspan17Q9D7W4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tspan17Q9D7W4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tspan17Q9D7W4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tspan17Q9D7W4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tspan17Q9D7W4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tspan17Q9D7W4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tspan17Q9D7W4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tspan17Q9D7W4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tspan17Q9D7W4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tspan17Q9D7W4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tspan17Q9D7W4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tspan17Q9D7W4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tspan17Q9D7W4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tspan17Q9D7W4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tspan17Q9D7W4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tspan17Q9D7W4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tspan17Q9D7W4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tspan17Q9D7W4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tspan17Q9D7W4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tspan17Q9D7W4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tspan17Q9D7W4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tspan17Q9D7W4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tspan17Q9D7W4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tspan17Q9D7W4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tspan17Q9D7W4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tspan17Q9D7W4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tspan17Q9D7W4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tspan17Q9D7W4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tspan17Q9D7W4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tspan17Q9D7W4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tspan17Q9D7W4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tspan17Q9D7W4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tspan17Q9D7W4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tspan17Q9D7W4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tspan17Q9D7W4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tspan17Q9D7W4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tspan17Q9D7W4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tspan17Q9D7W4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tspan17Q9D7W4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tspan17Q9D7W4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tspan17Q9D7W4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tspan17Q9D7W4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tspan17Q9D7W4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tspan17Q9D7W4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tspan17Q9D7W4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tspan17Q9D7W4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tspan17Q9D7W4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tspan17Q9D7W4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tspan17Q9D7W4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tspan17Q9D7W4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tspan17Q9D7W4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tspan17Q9D7W4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tspan17Q9D7W4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tspan17Q9D7W4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tspan17Q9D7W4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tspan17Q9D7W4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tspan17Q9D7W4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tspan17Q9D7W4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tspan17Q9D7W4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tspan17Q9D7W4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tspan17Q9D7W4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tspan17Q9D7W4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tspan17Q9D7W4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tspan17Q9D7W4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tspan17Q9D7W4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tspan17Q9D7W4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tspan17Q9D7W4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tspan17Q9D7W4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tspan17Q9D7W4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tspan17Q9D7W4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tspan17Q9D7W4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tspan17Q9D7W4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tspan17Q9D7W4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tspan17Q9D7W4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tspan17Q9D7W4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tspan17Q9D7W4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tspan17Q9D7W4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tspan17Q9D7W4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tspan17Q9D7W4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tspan17Q9D7W4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tspan17Q9D7W4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tspan17Q9D7W4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tspan17Q9D7W4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tspan17Q9D7W4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tspan17Q9D7W4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tspan17Q9D7W4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tspan17Q9D7W4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tspan17Q9D7W4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tspan17Q9D7W4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tspan17Q9D7W4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tspan17Q9D7W4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tspan17Q9D7W4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tspan17Q9D7W4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms