Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Srp19Q9D7A6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Srp19Q9D7A6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Srp19Q9D7A6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Srp19Q9D7A6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srp19Q9D7A6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srp19Q9D7A6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srp19Q9D7A6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srp19Q9D7A6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srp19Q9D7A6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srp19Q9D7A6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srp19Q9D7A6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Srp19Q9D7A6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srp19Q9D7A6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srp19Q9D7A6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srp19Q9D7A6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srp19Q9D7A6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srp19Q9D7A6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srp19Q9D7A6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srp19Q9D7A6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srp19Q9D7A6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srp19Q9D7A6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srp19Q9D7A6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srp19Q9D7A6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srp19Q9D7A6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srp19Q9D7A6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srp19Q9D7A6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srp19Q9D7A6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srp19Q9D7A6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srp19Q9D7A6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srp19Q9D7A6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srp19Q9D7A6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srp19Q9D7A6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srp19Q9D7A6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srp19Q9D7A6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srp19Q9D7A6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srp19Q9D7A6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srp19Q9D7A6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srp19Q9D7A6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srp19Q9D7A6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Srp19Q9D7A6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Srp19Q9D7A6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srp19Q9D7A6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srp19Q9D7A6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srp19Q9D7A6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srp19Q9D7A6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srp19Q9D7A6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srp19Q9D7A6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srp19Q9D7A6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srp19Q9D7A6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srp19Q9D7A6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srp19Q9D7A6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srp19Q9D7A6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srp19Q9D7A6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srp19Q9D7A6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srp19Q9D7A6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srp19Q9D7A6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srp19Q9D7A6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srp19Q9D7A6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srp19Q9D7A6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srp19Q9D7A6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srp19Q9D7A6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srp19Q9D7A6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srp19Q9D7A6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srp19Q9D7A6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srp19Q9D7A6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srp19Q9D7A6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srp19Q9D7A6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srp19Q9D7A6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srp19Q9D7A6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srp19Q9D7A6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srp19Q9D7A6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srp19Q9D7A6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srp19Q9D7A6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srp19Q9D7A6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srp19Q9D7A6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srp19Q9D7A6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srp19Q9D7A6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srp19Q9D7A6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srp19Q9D7A6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srp19Q9D7A6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srp19Q9D7A6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srp19Q9D7A6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srp19Q9D7A6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srp19Q9D7A6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srp19Q9D7A6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srp19Q9D7A6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srp19Q9D7A6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srp19Q9D7A6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srp19Q9D7A6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srp19Q9D7A6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srp19Q9D7A6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srp19Q9D7A6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srp19Q9D7A6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srp19Q9D7A6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srp19Q9D7A6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Srp19Q9D7A6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Srp19Q9D7A6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Srp19Q9D7A6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Srp19Q9D7A6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 291.8 ms