Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Klhl40Q9D783 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Klhl40Q9D783 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Klhl40Q9D783 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Klhl40Q9D783 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Klhl40Q9D783 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Klhl40Q9D783 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Klhl40Q9D783 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Klhl40Q9D783 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Klhl40Q9D783 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Klhl40Q9D783 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Klhl40Q9D783 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Klhl40Q9D783 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Klhl40Q9D783 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Klhl40Q9D783 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Klhl40Q9D783 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Klhl40Q9D783 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Klhl40Q9D783 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Klhl40Q9D783 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Klhl40Q9D783 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Klhl40Q9D783 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Klhl40Q9D783 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms