Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec23bQ9D662 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec23bQ9D662 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec23bQ9D662 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec23bQ9D662 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec23bQ9D662 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec23bQ9D662 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec23bQ9D662 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec23bQ9D662 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec23bQ9D662 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec23bQ9D662 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec23bQ9D662 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec23bQ9D662 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec23bQ9D662 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec23bQ9D662 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec23bQ9D662 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec23bQ9D662 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec23bQ9D662 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec23bQ9D662 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec23bQ9D662 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec23bQ9D662 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec23bQ9D662 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec23bQ9D662 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec23bQ9D662 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec23bQ9D662 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sec23bQ9D662 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sec23bQ9D662 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec23bQ9D662 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec23bQ9D662 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec23bQ9D662 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec23bQ9D662 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec23bQ9D662 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sec23bQ9D662 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec23bQ9D662 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec23bQ9D662 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec23bQ9D662 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sec23bQ9D662 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec23bQ9D662 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sec23bQ9D662 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sec23bQ9D662 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec23bQ9D662 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec23bQ9D662 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec23bQ9D662 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec23bQ9D662 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec23bQ9D662 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec23bQ9D662 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec23bQ9D662 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec23bQ9D662 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec23bQ9D662 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec23bQ9D662 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec23bQ9D662 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec23bQ9D662 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec23bQ9D662 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec23bQ9D662 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec23bQ9D662 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec23bQ9D662 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec23bQ9D662 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec23bQ9D662 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec23bQ9D662 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec23bQ9D662 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec23bQ9D662 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sec23bQ9D662 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sec23bQ9D662 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sec23bQ9D662 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sec23bQ9D662 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec23bQ9D662 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec23bQ9D662 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec23bQ9D662 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec23bQ9D662 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec23bQ9D662 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec23bQ9D662 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec23bQ9D662 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec23bQ9D662 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sec23bQ9D662 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sec23bQ9D662 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec23bQ9D662 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec23bQ9D662 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec23bQ9D662 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec23bQ9D662 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec23bQ9D662 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec23bQ9D662 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec23bQ9D662 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec23bQ9D662 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec23bQ9D662 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec23bQ9D662 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec23bQ9D662 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec23bQ9D662 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec23bQ9D662 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec23bQ9D662 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec23bQ9D662 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec23bQ9D662 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec23bQ9D662 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec23bQ9D662 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec23bQ9D662 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec23bQ9D662 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec23bQ9D662 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec23bQ9D662 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec23bQ9D662 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec23bQ9D662 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec23bQ9D662 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms