Protein–RNA interactions for Protein: Q9D515

Slxl1, Slx-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slxl1Q9D515 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slxl1Q9D515 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slxl1Q9D515 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slxl1Q9D515 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slxl1Q9D515 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slxl1Q9D515 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slxl1Q9D515 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slxl1Q9D515 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slxl1Q9D515 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slxl1Q9D515 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slxl1Q9D515 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Slxl1Q9D515 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slxl1Q9D515 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slxl1Q9D515 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slxl1Q9D515 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slxl1Q9D515 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slxl1Q9D515 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slxl1Q9D515 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slxl1Q9D515 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Slxl1Q9D515 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slxl1Q9D515 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slxl1Q9D515 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slxl1Q9D515 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slxl1Q9D515 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slxl1Q9D515 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slxl1Q9D515 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slxl1Q9D515 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Slxl1Q9D515 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slxl1Q9D515 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slxl1Q9D515 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slxl1Q9D515 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slxl1Q9D515 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slxl1Q9D515 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slxl1Q9D515 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slxl1Q9D515 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slxl1Q9D515 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slxl1Q9D515 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slxl1Q9D515 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slxl1Q9D515 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slxl1Q9D515 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slxl1Q9D515 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slxl1Q9D515 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Slxl1Q9D515 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slxl1Q9D515 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slxl1Q9D515 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slxl1Q9D515 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slxl1Q9D515 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slxl1Q9D515 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slxl1Q9D515 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slxl1Q9D515 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slxl1Q9D515 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slxl1Q9D515 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slxl1Q9D515 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slxl1Q9D515 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slxl1Q9D515 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slxl1Q9D515 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slxl1Q9D515 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slxl1Q9D515 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slxl1Q9D515 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slxl1Q9D515 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slxl1Q9D515 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Slxl1Q9D515 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slxl1Q9D515 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slxl1Q9D515 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slxl1Q9D515 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slxl1Q9D515 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slxl1Q9D515 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slxl1Q9D515 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slxl1Q9D515 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slxl1Q9D515 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slxl1Q9D515 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slxl1Q9D515 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slxl1Q9D515 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slxl1Q9D515 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slxl1Q9D515 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slxl1Q9D515 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Slxl1Q9D515 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slxl1Q9D515 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slxl1Q9D515 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slxl1Q9D515 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slxl1Q9D515 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slxl1Q9D515 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slxl1Q9D515 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slxl1Q9D515 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slxl1Q9D515 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slxl1Q9D515 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slxl1Q9D515 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slxl1Q9D515 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slxl1Q9D515 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Slxl1Q9D515 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slxl1Q9D515 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Slxl1Q9D515 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slxl1Q9D515 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slxl1Q9D515 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slxl1Q9D515 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slxl1Q9D515 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slxl1Q9D515 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slxl1Q9D515 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slxl1Q9D515 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slxl1Q9D515 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms