Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2al3Q9D4U4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2al3Q9D4U4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2al3Q9D4U4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2al3Q9D4U4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2al3Q9D4U4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
H2al3Q9D4U4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2al3Q9D4U4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2al3Q9D4U4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2al3Q9D4U4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2al3Q9D4U4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2al3Q9D4U4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2al3Q9D4U4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2al3Q9D4U4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
H2al3Q9D4U4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2al3Q9D4U4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2al3Q9D4U4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
H2al3Q9D4U4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2al3Q9D4U4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2al3Q9D4U4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2al3Q9D4U4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2al3Q9D4U4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2al3Q9D4U4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2al3Q9D4U4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2al3Q9D4U4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2al3Q9D4U4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2al3Q9D4U4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2al3Q9D4U4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2al3Q9D4U4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2al3Q9D4U4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2al3Q9D4U4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2al3Q9D4U4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2al3Q9D4U4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2al3Q9D4U4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2al3Q9D4U4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2al3Q9D4U4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2al3Q9D4U4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2al3Q9D4U4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2al3Q9D4U4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2al3Q9D4U4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2al3Q9D4U4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2al3Q9D4U4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2al3Q9D4U4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2al3Q9D4U4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2al3Q9D4U4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2al3Q9D4U4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2al3Q9D4U4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2al3Q9D4U4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2al3Q9D4U4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2al3Q9D4U4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
H2al3Q9D4U4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2al3Q9D4U4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2al3Q9D4U4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2al3Q9D4U4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2al3Q9D4U4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2al3Q9D4U4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2al3Q9D4U4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2al3Q9D4U4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
H2al3Q9D4U4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2al3Q9D4U4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2al3Q9D4U4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2al3Q9D4U4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2al3Q9D4U4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2al3Q9D4U4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2al3Q9D4U4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2al3Q9D4U4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2al3Q9D4U4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2al3Q9D4U4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2al3Q9D4U4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2al3Q9D4U4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2al3Q9D4U4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2al3Q9D4U4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2al3Q9D4U4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2al3Q9D4U4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2al3Q9D4U4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2al3Q9D4U4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2al3Q9D4U4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2al3Q9D4U4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2al3Q9D4U4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2al3Q9D4U4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2al3Q9D4U4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2al3Q9D4U4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2al3Q9D4U4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2al3Q9D4U4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2al3Q9D4U4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2al3Q9D4U4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2al3Q9D4U4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2al3Q9D4U4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2al3Q9D4U4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2al3Q9D4U4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2al3Q9D4U4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2al3Q9D4U4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2al3Q9D4U4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2al3Q9D4U4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2al3Q9D4U4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
H2al3Q9D4U4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2al3Q9D4U4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2al3Q9D4U4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2al3Q9D4U4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2al3Q9D4U4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms