Protein–RNA interactions for Protein: Q9D404

Oxsm, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OxsmQ9D404 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OxsmQ9D404 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OxsmQ9D404 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OxsmQ9D404 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OxsmQ9D404 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OxsmQ9D404 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OxsmQ9D404 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OxsmQ9D404 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OxsmQ9D404 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OxsmQ9D404 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OxsmQ9D404 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OxsmQ9D404 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OxsmQ9D404 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OxsmQ9D404 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OxsmQ9D404 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OxsmQ9D404 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OxsmQ9D404 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OxsmQ9D404 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OxsmQ9D404 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OxsmQ9D404 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OxsmQ9D404 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OxsmQ9D404 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OxsmQ9D404 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OxsmQ9D404 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OxsmQ9D404 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
OxsmQ9D404 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OxsmQ9D404 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OxsmQ9D404 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OxsmQ9D404 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OxsmQ9D404 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OxsmQ9D404 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.28■■□□□ 1
OxsmQ9D404 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OxsmQ9D404 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OxsmQ9D404 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.27■■□□□ 1
OxsmQ9D404 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
OxsmQ9D404 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
OxsmQ9D404 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OxsmQ9D404 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
OxsmQ9D404 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OxsmQ9D404 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
OxsmQ9D404 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OxsmQ9D404 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OxsmQ9D404 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OxsmQ9D404 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OxsmQ9D404 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OxsmQ9D404 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OxsmQ9D404 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OxsmQ9D404 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OxsmQ9D404 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OxsmQ9D404 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OxsmQ9D404 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OxsmQ9D404 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OxsmQ9D404 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OxsmQ9D404 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
OxsmQ9D404 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OxsmQ9D404 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OxsmQ9D404 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OxsmQ9D404 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OxsmQ9D404 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OxsmQ9D404 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OxsmQ9D404 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
OxsmQ9D404 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OxsmQ9D404 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OxsmQ9D404 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OxsmQ9D404 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OxsmQ9D404 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OxsmQ9D404 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OxsmQ9D404 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OxsmQ9D404 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OxsmQ9D404 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OxsmQ9D404 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OxsmQ9D404 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OxsmQ9D404 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
OxsmQ9D404 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OxsmQ9D404 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OxsmQ9D404 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OxsmQ9D404 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OxsmQ9D404 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OxsmQ9D404 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OxsmQ9D404 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
OxsmQ9D404 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OxsmQ9D404 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OxsmQ9D404 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OxsmQ9D404 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OxsmQ9D404 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OxsmQ9D404 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OxsmQ9D404 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OxsmQ9D404 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OxsmQ9D404 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OxsmQ9D404 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OxsmQ9D404 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OxsmQ9D404 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OxsmQ9D404 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OxsmQ9D404 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OxsmQ9D404 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OxsmQ9D404 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
OxsmQ9D404 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OxsmQ9D404 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OxsmQ9D404 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OxsmQ9D404 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms