Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stx17Q9D0I4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stx17Q9D0I4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stx17Q9D0I4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stx17Q9D0I4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stx17Q9D0I4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stx17Q9D0I4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stx17Q9D0I4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stx17Q9D0I4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stx17Q9D0I4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stx17Q9D0I4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stx17Q9D0I4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stx17Q9D0I4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stx17Q9D0I4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stx17Q9D0I4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx17Q9D0I4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx17Q9D0I4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx17Q9D0I4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx17Q9D0I4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stx17Q9D0I4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stx17Q9D0I4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stx17Q9D0I4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stx17Q9D0I4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stx17Q9D0I4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stx17Q9D0I4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stx17Q9D0I4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stx17Q9D0I4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stx17Q9D0I4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stx17Q9D0I4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stx17Q9D0I4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stx17Q9D0I4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stx17Q9D0I4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Stx17Q9D0I4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stx17Q9D0I4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stx17Q9D0I4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stx17Q9D0I4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stx17Q9D0I4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Stx17Q9D0I4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stx17Q9D0I4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stx17Q9D0I4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stx17Q9D0I4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stx17Q9D0I4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stx17Q9D0I4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stx17Q9D0I4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stx17Q9D0I4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stx17Q9D0I4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stx17Q9D0I4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stx17Q9D0I4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stx17Q9D0I4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stx17Q9D0I4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stx17Q9D0I4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stx17Q9D0I4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stx17Q9D0I4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stx17Q9D0I4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stx17Q9D0I4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stx17Q9D0I4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stx17Q9D0I4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stx17Q9D0I4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stx17Q9D0I4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Stx17Q9D0I4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stx17Q9D0I4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stx17Q9D0I4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stx17Q9D0I4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stx17Q9D0I4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stx17Q9D0I4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stx17Q9D0I4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stx17Q9D0I4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stx17Q9D0I4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stx17Q9D0I4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Stx17Q9D0I4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stx17Q9D0I4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stx17Q9D0I4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stx17Q9D0I4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stx17Q9D0I4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stx17Q9D0I4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stx17Q9D0I4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stx17Q9D0I4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stx17Q9D0I4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stx17Q9D0I4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stx17Q9D0I4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stx17Q9D0I4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stx17Q9D0I4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stx17Q9D0I4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stx17Q9D0I4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stx17Q9D0I4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stx17Q9D0I4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stx17Q9D0I4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stx17Q9D0I4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Stx17Q9D0I4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Stx17Q9D0I4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Stx17Q9D0I4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stx17Q9D0I4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stx17Q9D0I4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stx17Q9D0I4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stx17Q9D0I4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stx17Q9D0I4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stx17Q9D0I4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stx17Q9D0I4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stx17Q9D0I4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stx17Q9D0I4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms