Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ndc80Q9D0F1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndc80Q9D0F1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndc80Q9D0F1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndc80Q9D0F1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndc80Q9D0F1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndc80Q9D0F1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndc80Q9D0F1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndc80Q9D0F1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndc80Q9D0F1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndc80Q9D0F1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndc80Q9D0F1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndc80Q9D0F1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ndc80Q9D0F1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndc80Q9D0F1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndc80Q9D0F1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndc80Q9D0F1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndc80Q9D0F1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ndc80Q9D0F1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ndc80Q9D0F1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndc80Q9D0F1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndc80Q9D0F1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndc80Q9D0F1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndc80Q9D0F1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndc80Q9D0F1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndc80Q9D0F1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndc80Q9D0F1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndc80Q9D0F1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndc80Q9D0F1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndc80Q9D0F1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndc80Q9D0F1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndc80Q9D0F1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ndc80Q9D0F1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ndc80Q9D0F1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndc80Q9D0F1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndc80Q9D0F1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ndc80Q9D0F1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ndc80Q9D0F1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ndc80Q9D0F1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndc80Q9D0F1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndc80Q9D0F1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndc80Q9D0F1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndc80Q9D0F1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ndc80Q9D0F1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ndc80Q9D0F1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ndc80Q9D0F1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ndc80Q9D0F1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ndc80Q9D0F1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ndc80Q9D0F1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ndc80Q9D0F1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ndc80Q9D0F1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ndc80Q9D0F1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ndc80Q9D0F1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ndc80Q9D0F1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ndc80Q9D0F1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndc80Q9D0F1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndc80Q9D0F1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndc80Q9D0F1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ndc80Q9D0F1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ndc80Q9D0F1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ndc80Q9D0F1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ndc80Q9D0F1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ndc80Q9D0F1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ndc80Q9D0F1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ndc80Q9D0F1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ndc80Q9D0F1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ndc80Q9D0F1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ndc80Q9D0F1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ndc80Q9D0F1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ndc80Q9D0F1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ndc80Q9D0F1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ndc80Q9D0F1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ndc80Q9D0F1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ndc80Q9D0F1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ndc80Q9D0F1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ndc80Q9D0F1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ndc80Q9D0F1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ndc80Q9D0F1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ndc80Q9D0F1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ndc80Q9D0F1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ndc80Q9D0F1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ndc80Q9D0F1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ndc80Q9D0F1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ndc80Q9D0F1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndc80Q9D0F1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndc80Q9D0F1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndc80Q9D0F1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndc80Q9D0F1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndc80Q9D0F1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndc80Q9D0F1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndc80Q9D0F1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndc80Q9D0F1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndc80Q9D0F1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndc80Q9D0F1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndc80Q9D0F1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndc80Q9D0F1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndc80Q9D0F1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndc80Q9D0F1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ndc80Q9D0F1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ndc80Q9D0F1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms