Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zcchc8Q9CYA6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zcchc8Q9CYA6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zcchc8Q9CYA6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zcchc8Q9CYA6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zcchc8Q9CYA6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zcchc8Q9CYA6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zcchc8Q9CYA6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Zcchc8Q9CYA6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zcchc8Q9CYA6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Zcchc8Q9CYA6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zcchc8Q9CYA6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zcchc8Q9CYA6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zcchc8Q9CYA6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zcchc8Q9CYA6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zcchc8Q9CYA6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zcchc8Q9CYA6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zcchc8Q9CYA6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zcchc8Q9CYA6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zcchc8Q9CYA6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zcchc8Q9CYA6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zcchc8Q9CYA6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zcchc8Q9CYA6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zcchc8Q9CYA6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zcchc8Q9CYA6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zcchc8Q9CYA6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zcchc8Q9CYA6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Zcchc8Q9CYA6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zcchc8Q9CYA6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zcchc8Q9CYA6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zcchc8Q9CYA6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zcchc8Q9CYA6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zcchc8Q9CYA6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Zcchc8Q9CYA6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zcchc8Q9CYA6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zcchc8Q9CYA6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zcchc8Q9CYA6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zcchc8Q9CYA6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zcchc8Q9CYA6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Zcchc8Q9CYA6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zcchc8Q9CYA6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zcchc8Q9CYA6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zcchc8Q9CYA6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zcchc8Q9CYA6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zcchc8Q9CYA6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zcchc8Q9CYA6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zcchc8Q9CYA6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zcchc8Q9CYA6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zcchc8Q9CYA6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zcchc8Q9CYA6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zcchc8Q9CYA6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zcchc8Q9CYA6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zcchc8Q9CYA6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zcchc8Q9CYA6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zcchc8Q9CYA6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zcchc8Q9CYA6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zcchc8Q9CYA6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zcchc8Q9CYA6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zcchc8Q9CYA6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zcchc8Q9CYA6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zcchc8Q9CYA6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zcchc8Q9CYA6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zcchc8Q9CYA6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zcchc8Q9CYA6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zcchc8Q9CYA6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zcchc8Q9CYA6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zcchc8Q9CYA6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Zcchc8Q9CYA6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zcchc8Q9CYA6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zcchc8Q9CYA6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zcchc8Q9CYA6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zcchc8Q9CYA6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zcchc8Q9CYA6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zcchc8Q9CYA6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zcchc8Q9CYA6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zcchc8Q9CYA6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zcchc8Q9CYA6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zcchc8Q9CYA6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zcchc8Q9CYA6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zcchc8Q9CYA6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zcchc8Q9CYA6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zcchc8Q9CYA6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zcchc8Q9CYA6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zcchc8Q9CYA6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zcchc8Q9CYA6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zcchc8Q9CYA6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zcchc8Q9CYA6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zcchc8Q9CYA6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zcchc8Q9CYA6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zcchc8Q9CYA6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zcchc8Q9CYA6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zcchc8Q9CYA6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zcchc8Q9CYA6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zcchc8Q9CYA6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zcchc8Q9CYA6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zcchc8Q9CYA6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zcchc8Q9CYA6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zcchc8Q9CYA6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zcchc8Q9CYA6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zcchc8Q9CYA6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms