Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ssu72Q9CY97 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ssu72Q9CY97 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ssu72Q9CY97 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ssu72Q9CY97 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ssu72Q9CY97 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ssu72Q9CY97 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ssu72Q9CY97 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ssu72Q9CY97 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssu72Q9CY97 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssu72Q9CY97 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssu72Q9CY97 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssu72Q9CY97 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssu72Q9CY97 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssu72Q9CY97 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssu72Q9CY97 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssu72Q9CY97 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ssu72Q9CY97 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ssu72Q9CY97 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ssu72Q9CY97 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ssu72Q9CY97 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ssu72Q9CY97 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssu72Q9CY97 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssu72Q9CY97 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssu72Q9CY97 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssu72Q9CY97 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssu72Q9CY97 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssu72Q9CY97 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssu72Q9CY97 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssu72Q9CY97 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssu72Q9CY97 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssu72Q9CY97 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ssu72Q9CY97 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssu72Q9CY97 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssu72Q9CY97 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ssu72Q9CY97 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ssu72Q9CY97 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ssu72Q9CY97 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ssu72Q9CY97 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ssu72Q9CY97 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ssu72Q9CY97 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ssu72Q9CY97 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssu72Q9CY97 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssu72Q9CY97 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssu72Q9CY97 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssu72Q9CY97 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssu72Q9CY97 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssu72Q9CY97 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssu72Q9CY97 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssu72Q9CY97 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ssu72Q9CY97 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssu72Q9CY97 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssu72Q9CY97 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssu72Q9CY97 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssu72Q9CY97 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssu72Q9CY97 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ssu72Q9CY97 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ssu72Q9CY97 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ssu72Q9CY97 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ssu72Q9CY97 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssu72Q9CY97 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssu72Q9CY97 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssu72Q9CY97 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssu72Q9CY97 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssu72Q9CY97 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ssu72Q9CY97 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ssu72Q9CY97 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ssu72Q9CY97 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ssu72Q9CY97 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ssu72Q9CY97 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ssu72Q9CY97 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ssu72Q9CY97 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ssu72Q9CY97 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ssu72Q9CY97 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ssu72Q9CY97 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssu72Q9CY97 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssu72Q9CY97 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssu72Q9CY97 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssu72Q9CY97 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssu72Q9CY97 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssu72Q9CY97 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssu72Q9CY97 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssu72Q9CY97 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssu72Q9CY97 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssu72Q9CY97 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssu72Q9CY97 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssu72Q9CY97 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssu72Q9CY97 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssu72Q9CY97 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssu72Q9CY97 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ssu72Q9CY97 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ssu72Q9CY97 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssu72Q9CY97 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssu72Q9CY97 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssu72Q9CY97 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssu72Q9CY97 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssu72Q9CY97 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssu72Q9CY97 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ssu72Q9CY97 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssu72Q9CY97 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms