Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY16

Mrps28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps28Q9CY16 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrps28Q9CY16 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrps28Q9CY16 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrps28Q9CY16 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrps28Q9CY16 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrps28Q9CY16 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrps28Q9CY16 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrps28Q9CY16 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrps28Q9CY16 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrps28Q9CY16 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrps28Q9CY16 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrps28Q9CY16 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrps28Q9CY16 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrps28Q9CY16 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrps28Q9CY16 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrps28Q9CY16 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrps28Q9CY16 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrps28Q9CY16 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrps28Q9CY16 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrps28Q9CY16 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrps28Q9CY16 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrps28Q9CY16 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrps28Q9CY16 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrps28Q9CY16 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrps28Q9CY16 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrps28Q9CY16 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrps28Q9CY16 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrps28Q9CY16 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrps28Q9CY16 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrps28Q9CY16 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrps28Q9CY16 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrps28Q9CY16 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrps28Q9CY16 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrps28Q9CY16 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrps28Q9CY16 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrps28Q9CY16 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrps28Q9CY16 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrps28Q9CY16 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrps28Q9CY16 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrps28Q9CY16 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrps28Q9CY16 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mrps28Q9CY16 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mrps28Q9CY16 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrps28Q9CY16 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrps28Q9CY16 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrps28Q9CY16 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrps28Q9CY16 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrps28Q9CY16 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrps28Q9CY16 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrps28Q9CY16 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrps28Q9CY16 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrps28Q9CY16 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrps28Q9CY16 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrps28Q9CY16 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrps28Q9CY16 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrps28Q9CY16 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrps28Q9CY16 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrps28Q9CY16 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrps28Q9CY16 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrps28Q9CY16 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrps28Q9CY16 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrps28Q9CY16 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrps28Q9CY16 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrps28Q9CY16 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrps28Q9CY16 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrps28Q9CY16 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrps28Q9CY16 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Mrps28Q9CY16 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrps28Q9CY16 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrps28Q9CY16 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrps28Q9CY16 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Mrps28Q9CY16 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrps28Q9CY16 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Mrps28Q9CY16 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mrps28Q9CY16 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mrps28Q9CY16 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mrps28Q9CY16 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrps28Q9CY16 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrps28Q9CY16 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Mrps28Q9CY16 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrps28Q9CY16 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrps28Q9CY16 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrps28Q9CY16 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrps28Q9CY16 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrps28Q9CY16 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrps28Q9CY16 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrps28Q9CY16 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrps28Q9CY16 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrps28Q9CY16 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrps28Q9CY16 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrps28Q9CY16 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrps28Q9CY16 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrps28Q9CY16 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrps28Q9CY16 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrps28Q9CY16 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrps28Q9CY16 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrps28Q9CY16 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrps28Q9CY16 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrps28Q9CY16 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrps28Q9CY16 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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