Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH3

3300002I08Rik, RIKEN cDNA 3300002I08, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3300002I08RikQ9CXH3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
3300002I08RikQ9CXH3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
3300002I08RikQ9CXH3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
3300002I08RikQ9CXH3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
3300002I08RikQ9CXH3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
3300002I08RikQ9CXH3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
3300002I08RikQ9CXH3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
3300002I08RikQ9CXH3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
3300002I08RikQ9CXH3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
3300002I08RikQ9CXH3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
3300002I08RikQ9CXH3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
3300002I08RikQ9CXH3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
3300002I08RikQ9CXH3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
3300002I08RikQ9CXH3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
3300002I08RikQ9CXH3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
3300002I08RikQ9CXH3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
3300002I08RikQ9CXH3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
3300002I08RikQ9CXH3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
3300002I08RikQ9CXH3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
3300002I08RikQ9CXH3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
3300002I08RikQ9CXH3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
3300002I08RikQ9CXH3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
3300002I08RikQ9CXH3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
3300002I08RikQ9CXH3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
3300002I08RikQ9CXH3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
3300002I08RikQ9CXH3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
3300002I08RikQ9CXH3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
3300002I08RikQ9CXH3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
3300002I08RikQ9CXH3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
3300002I08RikQ9CXH3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
3300002I08RikQ9CXH3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
3300002I08RikQ9CXH3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
3300002I08RikQ9CXH3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
3300002I08RikQ9CXH3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
3300002I08RikQ9CXH3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
3300002I08RikQ9CXH3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
3300002I08RikQ9CXH3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
3300002I08RikQ9CXH3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
3300002I08RikQ9CXH3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
3300002I08RikQ9CXH3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
3300002I08RikQ9CXH3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
3300002I08RikQ9CXH3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
3300002I08RikQ9CXH3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
3300002I08RikQ9CXH3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
3300002I08RikQ9CXH3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
3300002I08RikQ9CXH3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
3300002I08RikQ9CXH3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
3300002I08RikQ9CXH3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
3300002I08RikQ9CXH3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
3300002I08RikQ9CXH3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
3300002I08RikQ9CXH3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
3300002I08RikQ9CXH3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
3300002I08RikQ9CXH3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
3300002I08RikQ9CXH3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
3300002I08RikQ9CXH3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
3300002I08RikQ9CXH3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
3300002I08RikQ9CXH3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
3300002I08RikQ9CXH3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
3300002I08RikQ9CXH3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
3300002I08RikQ9CXH3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
3300002I08RikQ9CXH3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
3300002I08RikQ9CXH3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
3300002I08RikQ9CXH3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
3300002I08RikQ9CXH3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
3300002I08RikQ9CXH3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
3300002I08RikQ9CXH3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
3300002I08RikQ9CXH3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
3300002I08RikQ9CXH3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
3300002I08RikQ9CXH3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
3300002I08RikQ9CXH3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
3300002I08RikQ9CXH3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
3300002I08RikQ9CXH3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
3300002I08RikQ9CXH3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
3300002I08RikQ9CXH3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
3300002I08RikQ9CXH3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
3300002I08RikQ9CXH3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
3300002I08RikQ9CXH3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
3300002I08RikQ9CXH3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
3300002I08RikQ9CXH3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
3300002I08RikQ9CXH3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
3300002I08RikQ9CXH3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
3300002I08RikQ9CXH3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
3300002I08RikQ9CXH3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
3300002I08RikQ9CXH3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
3300002I08RikQ9CXH3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
3300002I08RikQ9CXH3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
3300002I08RikQ9CXH3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
3300002I08RikQ9CXH3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
3300002I08RikQ9CXH3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
3300002I08RikQ9CXH3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
3300002I08RikQ9CXH3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
3300002I08RikQ9CXH3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
3300002I08RikQ9CXH3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
3300002I08RikQ9CXH3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
3300002I08RikQ9CXH3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
3300002I08RikQ9CXH3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
3300002I08RikQ9CXH3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
3300002I08RikQ9CXH3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
3300002I08RikQ9CXH3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
3300002I08RikQ9CXH3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms