Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc17Q9CXD9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc17Q9CXD9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc17Q9CXD9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc17Q9CXD9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc17Q9CXD9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc17Q9CXD9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc17Q9CXD9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc17Q9CXD9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc17Q9CXD9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc17Q9CXD9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc17Q9CXD9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc17Q9CXD9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc17Q9CXD9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc17Q9CXD9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc17Q9CXD9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc17Q9CXD9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc17Q9CXD9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc17Q9CXD9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc17Q9CXD9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc17Q9CXD9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc17Q9CXD9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc17Q9CXD9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc17Q9CXD9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc17Q9CXD9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc17Q9CXD9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc17Q9CXD9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc17Q9CXD9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc17Q9CXD9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc17Q9CXD9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc17Q9CXD9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc17Q9CXD9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc17Q9CXD9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc17Q9CXD9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc17Q9CXD9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lrrc17Q9CXD9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrc17Q9CXD9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrc17Q9CXD9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc17Q9CXD9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc17Q9CXD9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc17Q9CXD9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc17Q9CXD9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc17Q9CXD9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc17Q9CXD9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc17Q9CXD9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc17Q9CXD9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc17Q9CXD9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc17Q9CXD9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc17Q9CXD9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc17Q9CXD9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc17Q9CXD9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc17Q9CXD9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc17Q9CXD9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc17Q9CXD9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc17Q9CXD9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc17Q9CXD9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc17Q9CXD9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc17Q9CXD9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc17Q9CXD9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc17Q9CXD9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc17Q9CXD9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc17Q9CXD9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc17Q9CXD9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc17Q9CXD9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc17Q9CXD9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc17Q9CXD9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc17Q9CXD9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc17Q9CXD9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc17Q9CXD9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc17Q9CXD9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc17Q9CXD9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc17Q9CXD9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc17Q9CXD9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc17Q9CXD9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc17Q9CXD9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc17Q9CXD9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc17Q9CXD9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc17Q9CXD9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc17Q9CXD9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc17Q9CXD9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc17Q9CXD9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc17Q9CXD9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc17Q9CXD9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc17Q9CXD9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc17Q9CXD9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc17Q9CXD9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc17Q9CXD9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc17Q9CXD9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc17Q9CXD9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc17Q9CXD9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc17Q9CXD9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc17Q9CXD9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc17Q9CXD9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc17Q9CXD9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc17Q9CXD9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc17Q9CXD9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrc17Q9CXD9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrc17Q9CXD9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrc17Q9CXD9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrc17Q9CXD9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
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