Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NubplQ9CWD8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NubplQ9CWD8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NubplQ9CWD8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NubplQ9CWD8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NubplQ9CWD8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NubplQ9CWD8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NubplQ9CWD8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NubplQ9CWD8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NubplQ9CWD8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NubplQ9CWD8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NubplQ9CWD8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NubplQ9CWD8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NubplQ9CWD8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NubplQ9CWD8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NubplQ9CWD8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NubplQ9CWD8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NubplQ9CWD8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NubplQ9CWD8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NubplQ9CWD8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NubplQ9CWD8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NubplQ9CWD8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NubplQ9CWD8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NubplQ9CWD8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NubplQ9CWD8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NubplQ9CWD8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NubplQ9CWD8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NubplQ9CWD8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NubplQ9CWD8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NubplQ9CWD8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NubplQ9CWD8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NubplQ9CWD8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NubplQ9CWD8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NubplQ9CWD8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NubplQ9CWD8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NubplQ9CWD8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NubplQ9CWD8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NubplQ9CWD8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NubplQ9CWD8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NubplQ9CWD8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NubplQ9CWD8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NubplQ9CWD8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NubplQ9CWD8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NubplQ9CWD8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NubplQ9CWD8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NubplQ9CWD8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NubplQ9CWD8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NubplQ9CWD8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NubplQ9CWD8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NubplQ9CWD8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NubplQ9CWD8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NubplQ9CWD8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NubplQ9CWD8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NubplQ9CWD8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NubplQ9CWD8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NubplQ9CWD8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NubplQ9CWD8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NubplQ9CWD8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NubplQ9CWD8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NubplQ9CWD8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NubplQ9CWD8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NubplQ9CWD8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NubplQ9CWD8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NubplQ9CWD8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NubplQ9CWD8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NubplQ9CWD8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NubplQ9CWD8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NubplQ9CWD8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NubplQ9CWD8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NubplQ9CWD8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NubplQ9CWD8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NubplQ9CWD8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NubplQ9CWD8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NubplQ9CWD8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NubplQ9CWD8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NubplQ9CWD8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NubplQ9CWD8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NubplQ9CWD8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NubplQ9CWD8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NubplQ9CWD8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NubplQ9CWD8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NubplQ9CWD8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NubplQ9CWD8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NubplQ9CWD8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NubplQ9CWD8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NubplQ9CWD8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NubplQ9CWD8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NubplQ9CWD8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NubplQ9CWD8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NubplQ9CWD8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NubplQ9CWD8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NubplQ9CWD8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NubplQ9CWD8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NubplQ9CWD8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NubplQ9CWD8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NubplQ9CWD8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NubplQ9CWD8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NubplQ9CWD8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NubplQ9CWD8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NubplQ9CWD8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms