Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK8

Sprr2a1, Small proline-rich protein 2A1, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr2a1Q9CQK8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sprr2a1Q9CQK8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sprr2a1Q9CQK8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sprr2a1Q9CQK8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sprr2a1Q9CQK8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sprr2a1Q9CQK8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sprr2a1Q9CQK8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sprr2a1Q9CQK8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sprr2a1Q9CQK8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sprr2a1Q9CQK8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sprr2a1Q9CQK8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sprr2a1Q9CQK8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sprr2a1Q9CQK8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sprr2a1Q9CQK8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sprr2a1Q9CQK8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sprr2a1Q9CQK8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sprr2a1Q9CQK8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sprr2a1Q9CQK8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sprr2a1Q9CQK8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sprr2a1Q9CQK8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sprr2a1Q9CQK8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sprr2a1Q9CQK8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sprr2a1Q9CQK8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sprr2a1Q9CQK8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sprr2a1Q9CQK8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms