Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snrpb2Q9CQI7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snrpb2Q9CQI7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snrpb2Q9CQI7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snrpb2Q9CQI7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snrpb2Q9CQI7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Snrpb2Q9CQI7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snrpb2Q9CQI7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snrpb2Q9CQI7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snrpb2Q9CQI7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snrpb2Q9CQI7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snrpb2Q9CQI7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrpb2Q9CQI7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrpb2Q9CQI7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrpb2Q9CQI7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snrpb2Q9CQI7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snrpb2Q9CQI7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Snrpb2Q9CQI7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snrpb2Q9CQI7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snrpb2Q9CQI7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snrpb2Q9CQI7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snrpb2Q9CQI7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snrpb2Q9CQI7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrpb2Q9CQI7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrpb2Q9CQI7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrpb2Q9CQI7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrpb2Q9CQI7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrpb2Q9CQI7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrpb2Q9CQI7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrpb2Q9CQI7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrpb2Q9CQI7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrpb2Q9CQI7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrpb2Q9CQI7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrpb2Q9CQI7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snrpb2Q9CQI7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrpb2Q9CQI7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrpb2Q9CQI7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrpb2Q9CQI7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrpb2Q9CQI7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrpb2Q9CQI7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrpb2Q9CQI7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrpb2Q9CQI7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snrpb2Q9CQI7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snrpb2Q9CQI7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrpb2Q9CQI7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrpb2Q9CQI7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrpb2Q9CQI7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snrpb2Q9CQI7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snrpb2Q9CQI7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snrpb2Q9CQI7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snrpb2Q9CQI7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snrpb2Q9CQI7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snrpb2Q9CQI7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snrpb2Q9CQI7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snrpb2Q9CQI7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snrpb2Q9CQI7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrpb2Q9CQI7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrpb2Q9CQI7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrpb2Q9CQI7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrpb2Q9CQI7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrpb2Q9CQI7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrpb2Q9CQI7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrpb2Q9CQI7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snrpb2Q9CQI7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snrpb2Q9CQI7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snrpb2Q9CQI7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrpb2Q9CQI7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrpb2Q9CQI7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrpb2Q9CQI7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrpb2Q9CQI7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrpb2Q9CQI7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrpb2Q9CQI7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snrpb2Q9CQI7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snrpb2Q9CQI7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snrpb2Q9CQI7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Snrpb2Q9CQI7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Snrpb2Q9CQI7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Snrpb2Q9CQI7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrpb2Q9CQI7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrpb2Q9CQI7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrpb2Q9CQI7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrpb2Q9CQI7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrpb2Q9CQI7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrpb2Q9CQI7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrpb2Q9CQI7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrpb2Q9CQI7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrpb2Q9CQI7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrpb2Q9CQI7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrpb2Q9CQI7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrpb2Q9CQI7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snrpb2Q9CQI7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snrpb2Q9CQI7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snrpb2Q9CQI7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrpb2Q9CQI7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrpb2Q9CQI7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrpb2Q9CQI7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrpb2Q9CQI7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrpb2Q9CQI7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrpb2Q9CQI7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrpb2Q9CQI7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms